Cartographique génétique
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2006-11-17T11:47:03Z
Leag
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Correction d'homonymie vers [[Mutation]]
La '''cartographie génétique''' est la construction d’une carte soit localisée autour d’un [[gène]], soit à base large portant sur le [[génome]] entier. Plus généralement, c’est la détermination de la position d’un [[locus]] ([[gène]] ou [[marqueur génétique]]) sur un [[chromosome]].
== Objectif de la cartographie génétique ==
L'action de cartographier consiste à déterminer les positions relatives des [[loci]] (gènes ou séquences d’ADN) sur un [[chromosome]]. Les cartes de liaison sont obtenues à partir de la fréquence de recombinaison entre les [[loci]]. Les cartes physiques sont généralement obtenues par l’utilisation de l’hybridation ''[[in situ]]'' des fragments d’[[Acide désoxyribonucléique|ADN]] clonés avec des chromosomes en [[métaphase]], ou l’utilisation d’hybrides somatiques ou hybrides d’irradiation.
== Types de cartes ==
Un carte étant un diagramme représentant la position relative des [[loci]] sur un [[chromosome]] et les distances entre eux, on distingue les types de cartes suivants :
* Une '''carte génétique''' est un alignement linéaire des gènes sur un chromosome, basé sur les fréquences de recombinaison (carte de liaison) ou sur l’emplacement physique (carte physique ou chromosomique). Les termes de carte factorielle, ou de carte statistique, sont également fréquemment employés comme synonymes de carte génétique.
* Une '''carte de liaison''' est un diagramme linéaire ou circulaire représentant les positions relatives des gènes sur un chromosome qui sont déterminées par la fraction de recombinaison.
* Une '''carte physique''' ou '''carte chromosomique''' porte l'indication de la séparation, en paires de bases (souvent abrégées en ''pb''), entre les paires de loci liés.
* Une '''carte de restriction''' montre l'arrangement linéaire des sites de reconnaissance de l’endonucléase de restriction le long d’une molécule d’[[Acide désoxyribonucléique|ADN]].
Il est à noter que des ''cartes cytologiques'' des gènes associés aux [[Mutation (génétique)|mutation]]s peuvent être établies lorsque certaines mutations ont un support chromosomique qui peut être mis en évidence par les techniques de colorations de bandes des chromosomes.
== Types de cartographies ==
La '''cartographie comparée''' est la comparaison de l’emplacement des gènes et des marqueurs sur une carte chromosomique entre [[espèce]]s. Dans les comparaisons entre des espèces proches, on découvre un degré élevé de conservation :
* de la co-linéarité : phénomène par lequel l’ordre des gènes est préservé entre des espèces différentes.
* de la [[synténie]] : présence simultanée sur le même chromosome de deux ou plusieurs loci, indépendamment de leur liaison génétique. La notion de synténie est de plus en plus utilisé pour décrire la conservation de l’ordre des gènes entre deux espèces apparentées.
Dans ce cas, la localisation de plusieurs gènes peut être prédite grâce à un modèle de données. Les comparaisons entre espèces [[phylogénèse|phylogénétiquement]] éloignées révèlent une augmentation de la perte de synténie.
La '''cartographie ''S1''''' est une méthode de caractérisation des modifications posttranscriptionelles dans l’ARN ([[épissage]] des [[intron]]s, etc.) par hybridation de l’[[Acide ribonucléique|ARN]] avec un [[Acide désoxyribonucléique|ADN]] simple brin et son traitement avec une [[nucléase]] S1.
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[[Catégorie:Génétique]]