Chlorophyta (classification phylogénétique)
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2008-05-20T22:28:02Z
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==Introduction==
Cette page a pour objet de présenter un [[arbre phylogénétique]] des [[Chlorophyta]] (ou [[algues vertes]]), c’est-à-dire un arbre mettant en lumière les relations évolutives complexes (relations groupes ancestraux - groupes descendants) existantes entre les différents organismes vivants, ou [[taxon|taxa]], constituant ce groupe. Du fait de ses méthodes nouvelles basées sur la biologie moléculaire, la [[phylogénie]], science récente à l'origine de la [[classification phylogénétique]] du vivant, est en plein essor et parfois en contradiction avec l'ancienne [[classification classique]], majoritairement basée, elle, sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi, certains points particuliers font parfois encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.<br/>
Cet arbre présente aussi bien les organismes encore existants aujourd'hui que les groupes éteints (incluant les groupes fossiles).
== Arbre phylogénétique ==
L'arbre ci-dessous reprend la division, aujourd'hui largement admise, des '''''Algues vertes''''' en deux taxa : les [[Chlorophyta|Chlorophytes]], monophylétiques, d'une part, et d'autre part les [[Charophyta|Charophytes]], paraphylétiques, à la base de l'arbre comportant les [[Embryophyta|Embryophytes]]. Pour les niveaux supérieurs, on suit l'article de Lewis et McCourt (2004) cité en bas de page. Les [[Prasinophyceae|Prasinophycées]] sont paraphylétiques : elles comportaient les groupes qui figurent à la base de la branche '''Chlorophyta''' dans l'arbre ci-dessous (des ''Pédinophycées'' aux ''Chlorodendrales'', plus les ''Mésostigmatophycées'' dont l'emplacement est incertain).
En attendant mieux, la liste des ordres et familles des ''Chlorophytina'' (les ''Ulvophyta'' de [[Classification phylogénétique de Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader|Lecointre et Le Guyader]]) est classique et indicative, les taxons des [[Chlorophyceae|Chlorophycées]], notamment, devant être largement paraphylétiques.
=== Arbre résumé ===
[[Archaeplastida (classification phylogénétique)|▲]]
└─o [[Viridiplantae]] ou [[Chlorobionta]]
├─o [[Streptophyta]] ou [[Charophyta]]
│ ├─? [[Mesostigmatophyceae]]
│ └─o
│ ├─o [[Chlorokybophyceae]]
│ └─o
│ ├─o [[Klebsormidiophyceae]]
│ └─o [[Phragmoplastophyta]]
│ │
│ ├─o [[Zygnematophyceae]]
│ │
│ └─o [[Streptophytina]]
│ ├─o [[Charophyceae]] ou [[Charales]]
│ ├─o [[Coleochaetales]]
│ └─o '''[[Embryophyta|EMBRYOPHYTA]]''' (voir ''[[Archaeplastida (classification phylogénétique)]]'')
│
└─o '''[[Chlorophyta|CHLOROPHYTA]]'''
├─? [[Pedinophyceae]]
└─o
├─o [[Pyramimonadales]]
└─o
├─o [[Mamiellales]]
└─o
├─o [[Pseudoscourfieldiales]]
└─o
├─o [[Chlorodendrales]]
└─o [[Chlorophytina]]
├─o [[Ulvophyceae]]
└─o
├─o [[Trebouxiophyceae]]
└─o [[Chlorophyceae]]
=== Arbre développé ===
{{boîte déroulante début|titre=Arbre développé}}
[[Archaeplastida (classification phylogénétique)|▲]]
└─o [[Viridiplantae]] ou [[Chlorobionta]]
│
├─o [[Streptophyta]] ou [[Charophyta]]
│ ├─? [[Mesostigmatophyceae]]
│ └─o
│ ├─o [[Chlorokybophyceae]]
│ └─o
│ ├─o [[Klebsormidiophyceae]]
│ │ ├─o [[Klebsormidiaceae]]
│ │ └─o [[Elakatotrichaceae]]
│ └─o [[Phragmoplastophyta]]
│ │
│ ├─o [[Zygnematophyceae]] [[Zygnematophyta (classification phylogénétique)|►]]
│ │
│ └─o [[Plasmodesmophyta]] ou [[Streptophytina]]
│ ├─o [[Charophyceae]] ou [[Charales]]
│ ├─o [[Coleochaetales]]
│ │
│ └─o '''[[Embryophyta|EMBRYOPHYTA]]''' [[Archaeplastida (classification phylogénétique)|►]]
│
└─o '''[[Chlorophyta|CHLOROPHYTA]]'''
├─? [[Pedinophyceae]] ou [[Pedinomonadales]]
├─? [[Scourfieldiales]]
└─o
├─? ''[[Monomastix]]''
├─o
│ ├─? ''[[Nephroselmis]]''
│ └─o [[Pyramimonadales]]
└─o
├─o [[Mamiellales]]
└─o
├─o ''[[Pycnococcus]]''
├─o ''[[Prasinococcus]]''
├─? ''[[Picocystis]]''
└─o
├─o [[Pseudoscourfieldiales]]
└─o
├─o [[Chlorodendrales]]
└─o [[Chlorophytina]]
├─o [[Ulvophyceae]]
│ ├─? [[Oltmansiellopsidales]]
│ └─o
│ ├─o
│ │ ├─o [[Ulotrichales]]
│ │ └─o [[Ulvales]]
│ │ ├─o [[Kornmanniaceae]]
│ │ ├─o [[Ulvellaceae]]
│ │ ├─o [[Ulvaceae]]
│ │ └─o [[Monostromataceae]]
│ └─o
│ ├─o [[Trentepohliales]]
│ └─o
│ ├─o
│ │ ├─o [[Siphonocladales]]
│ │ │ ├─o [[Siphonocladaceae]]
│ │ │ └─o [[Valoniaceae]]
│ │ └─o [[Cladophorales]]
│ │ ├─o [[Anadyomenaceae]]
│ │ ├─o [[Arnoldiellaceae]]
│ │ └─o [[Cladophoraceae]]
│ └─o
│ ├─o [[Dasycladales]]
│ │ ├─o [[Dasycladaceae]]
│ │ └─o [[Polyphysaceae]]
│ └─o [[Caulerpales]]
│ ├─o [[Halimedales]] ou [[Caulerpaceae]]
│ └─o [[Bryopsidales]]
│ ├─o [[Bryopsidaceae]]
│ ├─o [[Codiaceae]]
│ ├─o [[Derbesiaceae]]
│ ├─o [[Dichotomosiphonaceae]]
│ ├─o [[Ostreobiaceae]]
│ └─o [[Udoteaceae]]
└─o
├─o [[Trebouxiophyceae]]
│ ├─? [[Botryococcaceae]]
│ ├─? [[Ctenocladales]]
│ ├─o [[Chlorellales]]
│ │ ├─o [[Chlorellaceae]]
│ │ ├─o [[Eremosphaeraceae]]
│ │ └─o [[Oocystaceae]]
│ └─o
│ ├─o [[Prasiolales]]
│ └─o
│ ├─o [[Microthamniales]]
│ └─o [[Trebouxiales]]
└─o [[Chlorophyceae]]
├─? [[Microsporaceae]]
├─? [[Treubariaceae]]
├─? [[Phaeophilales]]
├─? [[Tetrasporales]]
│ ├─o [[Hypnomonadaceae]]
│ ├─o [[Palmellaceae]]
│ └─o [[Tetrasporaceae]]
├─o [[Chaetopeltidales]]
├─o [[Chaetophorales]]
│ ├─o [[Aphanochaetaceae]]
│ ├─o [[Chaetophoraceae]]
│ └─o [[Schizomeridaceae]]
├─o [[Oedogoniales]]
└─o
├─o [[Chlorococcales]]
│ ├─o [[Chlorococcaceae]]
│ └─o [[Coccomyxaceae]]
├─o [[Sphaeropleales]]
│ ├─o [[Hydrodictyaceae]]
│ ├─o [[Neochloridaceae]]
│ ├─o [[Scenedesmaceae]]
│ ├─o [[Selenastraceae]]
│ └─o [[Sphaeropleaceae]]
├─o [[Chlorosarcinales]]
└─o [[Chlamydomonadales]]
├─o [[Asteromonadaceae]]
├─o [[Astrephomenaceae]]
├─o [[Characiochloridaceae]]
├─o [[Characiosiphonaceae]]
├─o [[Chlamydomonadaceae]]
├─o [[Dunaliellaceae]]
├─o [[Golenkiniaceae]]
├─o [[Haematococcaceae]]
├─o [[Phacotaceae]]
├─o [[Spondylomoraceae]]
├─o [[Tetrabaenaceae]]
└─o [[Volvocaceae]]
{{boîte déroulante fin}}
==Débat scientifique relatif à la phylogénie des Chlorophyta==
Quelques questions à évoquer :
* la place des Mésostigmatophycées, anciennement partie des Prasinophycées, soit à la base des Charophytes (= Streptophytes), selon l'arbre ci-dessus, soit comme groupe-frère de toutes les autres ''Viridiplantae'' ;
* le détail de la phylogénie des anciennes Prasinophycées, et notamment la place des Pédinophycées (à la base des Chlorophytes, selon arbre ci-dessus, ou groupe-frère des Mamiellales, ou ...), et, en leur sein ou pas, des Scourfieldiales ;
* le détail de la phylogénie des ''Chlorophytina'', jusqu'au niveau des genres et espèces, parfois éclatés entre plusieurs familles au vu des analyses moléculaires (notamment chez les Chlorophycées) ;
* le détail de la phylogénie des algues charophytes (place des Zygnématophycées, monophylie et place des Coléochétophycées, réunion de celles-ci et des Charophycées ''s.s.'')...
==En savoir plus==
===Sources bibliographiques de référence===
* Louise A. Lewis, Richard M. McCourt (2004) [http://www.amjbot.org/cgi/reprint/91/10/1535.pdf « Green Algae and the Origin of Land Plants »], ''American Journal of Botany'' 91(10), pp. 1535–1556
* Bruno de Reviers (2003) ''Biologie et phylogénie des algues. Tome 2'', Paris : Belin (Belin Sup Sciences) ISBN 2-7011-3512-5
* Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader (2001, 2006³) ''Classification phylogénétique du vivant'', Belin, ISBN 2-7011-4273-3
===Autres sources bibliographiques===
* Cabioc'h, J., Floc'h, J.-Y., Le Toquin, A., Boudouresque, C.F., 2006. ''Guide des algues des mers d'Europe'', Delachaux et Niestlé (éd.). ISBN 260301384X.
===Sources internet===
* [http://www.algaebase.org/index.lasso?-session=abv3:52E973170f5ba171C0jkojE518C0 Algaebase.org]
* [http://www.fmnh.helsinki.fi/users/haaramo/Plantae/Viridiplantae.htm Mikko's Phylogeny Archive]
* [http://taxonomicon.taxonomy.nl/TaxonTree.aspx?id=3496 The Taxonomicon]
* [http://www.palaeos.org/Chlorophyta Palaeos.org]
* [http://starcentral.mbl.edu/microscope/portal.php?pagetitle=classification&BLOCKID=9&CHILDID=18228&namebankID=230546 Micro*scope]
* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?name=Chlorophyta NCBI Taxonomy Browser]
* [http://tolweb.org/Green_plants/2382 The Tree of Life Web Project]
===Liens internes===
* [[Chlorophyta]]
* [[Eukaryota (classification phylogénétique)]]
** [[Archaeplastida (classification phylogénétique)]]
* [[Arbre phylogénétique]]
* [[Classification phylogénétique de Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader]]
* [[Photo-guide taxinomique de la faune et de la flore sous-marine]]
* [[Photo-guide taxinomique du monde végétal]]
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[[Image:CaulerpaTaxifolia.jpg|300px|right|thumb|''[[Caulerpa taxifolia]]'' ([[Ulvophyceae]], [[Caulerpales]], [[Caulerpaceae]])]] [[Image:Ventricaria ventricosa.JPG|300px|right|thumb|''[[Ventricaria ventricosa]]'' ([[Chlorophyceae]])]] [[Image:Cladophora.JPG|300px|right|thumb|''[[Cladophora]] sp.'' ([[Ulvophyceae]], [[Cladophorales]])]] [[Image:Caulerpa prolifera.JPG|300px|right|thumb|''[[Caulerpa prolifera]]'' ([[Ulvophyceae]], [[Caulerpales]], [[Caulerpaceae]])]] [[Image:Chlamydomonas (10000x).jpg|300px|right|thumb|''[[Chlamydomonas]] sp.'' ([[Chlamydomonadaceae]]) (×10000)]]
[[Image:Haematococcus (2006 02 27).jpg|300px|right|thumb|''[[Haematococcus]] sp.'' ([[Chlorophyceae]])]]
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