Classification des virus 202713 28021102 2008-03-31T17:57:26Z Badmood 4507 nouveau style de bandeau de portail, voir [[Wikipédia:Prise de décision/Bandeaux de portail]] La '''classification des virus''' ne peut être intégrée à [[Classification scientifique des espèces|celle réalisée pour les êtres vivants]] du fait que les [[virus]] ne sont pas considéré comme [[Vie|vivant]], car ne pouvant se reproduire par leurs propres moyens. C'est ainsi qu'il a été nécessaire de mettre au point une classification particulière. Il en existe deux qui font autorité : * la [[classification Baltimore]], proposée par [[David Baltimore]], lauréat du [[Prix Nobel de physiologie ou médecine|prix Nobel de médecine]] en [[1975]], qui est basée sur le type d'[[acide nucléique]] des virus ([[Acide désoxyribonucléique|ADN]] ou [[Acide ribonucléique|ARN]]) et son mode d'[[Expression génétique|expression]] * la classification de l'[[International Committee on Taxonomy of Viruses]] (ICTV), qui utilise une méthode assez semblable à celle existant pour les êtres vivant ou les virus sans rangé par ordre, famille, sous-famille, genre et espèce. Ces deux méthodes de classifications ne sont pas antagonistes et peuvent tout à fait s'intégrer l'une à l'autre, car la classification de l'ICTV reprend certains critères de la classification Baltimore. Aucune des classifications n'est censée être [[phylogénétique]], car les virus ne partagent pas d'origine commune. ==Généralités== Les formes variées des virus résultent du fait que l'un des deux brins d'[[Acide désoxyribonucléique|ADN]] dans lesquels toutes les formes de vie cellulaire conservent leur [[information génétique]] est redondant, et que par conséquent les virus peuvent avoir des génomes à simple ou double brin. De plus, le génome de certains virus est formé d'[[Acide ribonucléique|ARN]] plutôt que d'ADN. L'ARN est présent dans les cellules comme intermédiaire lorsque les [[gène]]s sont traduits en [[protéine]]s. Le génome des [[virus à ARN]] peut être codé dans deux directions différentes : soit les gènes sont stockés dans la direction 5'->3' (polarité positive ou +), comme celle dans laquelle les gènes sont codés dans l'[[ARN messager]] des cellules, soit ils sont stockés dans la direction opposée (polarité négative ou -). La [[taxinomie]] des virus est similaire à celle des organismes cellulaires : :[[Ordre (biologie)|Ordre]] (''-virales'') ::[[Famille (biologie)|Famille]] (''-viridae'') :::[[Sous-famille (biologie)|Sous-Famille]] (''-virinae'') ::::[[Genre (biologie)|Genre]] (''-virus'') :::::[[Espèce]] Cependant, le code de nomenclature géré par le [[Comité International sur la Taxinomie des Virus]] diffère des autres sur plusieurs aspects. Pour l'essentiel, les noms des ordres et des familles sont mis en italiques et les noms des espèces ne suivent pas la [[nomenclature binomiale]] mais sont souvent de la forme ''[Virus] de la [maladie]''. La définition des ordres est très récente et a été délibérément lente ; à ce jour, seuls trois ont été nommés et la plupart des familles ne sont pas classées. Environ 80 familles et 4000 espèces de virus sont actuellement connues. ==Classification par type de génome== ===[[Virus à ADN]]=== ====Groupe I - [[Virus à ADN à double brin]]==== * Ordre des ''[[Caudovirales]]'' ([[bactériophage]]s à queue). ** Famille des ''[[Myoviridae]]'' - exemple ''[[phage T4]]'' ** Famille des ''[[Podoviridae]]'' ** Famille des ''[[Siphoviridae]]'' - exemple ''[[phage lambda|phage λ]]'' * Non attribué ** Famille des ''[[Ascovirus|Ascoviridae]]'' ** Famille des ''[[Adenoviridae]]'' - exemples ''[[kératite]]s'', ''[[angine]]s'' ou ''[[diarrhée]]s'' ** Famille des ''[[Asfivirus|Asfiviridae]]'' ** Famille des ''[[Baculoviridae]]'' ** Famille des ''[[Corticovirus|Corticoviridae]]'' ** Famille des ''[[Fusellovirus|Fuselloviridae]]'' ** Famille des ''[[Guttavirus|Guttaviridae]]'' ** Famille des ''[[hépadnavirus|hépadnaviridae]]'' - exemples les ''virus humains de l'[[hépatite B]]'' ou ''[[VHB]]'' ** Famille des ''[[Herpesviridae]]'' - exemples les ''virus humains de l'[[herpès]]'' ou le ''[[VZV]]'' (virus varicelle-zona) ** Famille des ''[[Iridoviridae]]'' ** Famille des ''[[Lipothrixviridae]]'' ** Famille des ''[[Whispovirus|Nimaviridae]]'' ** Famille des ''[[Papovaviridae]]'' - exemples ''[[Papillomavirus]]'' ou ''[[Polyomavirus]]'' (''[[SV40|virus simien 40]]'') ** Famille des ''[[Phycodnaviridae]]'' ** Famille des ''[[Plasmavirus|Plasmaviridae]]'' ** Famille des ''[[Poxviridae]]'' - exemples ''virus de la [[vaccine]]'', ''virus de la [[variole]]'' ** Famille des ''[[Rudivirus|Rudiviridae]]'' ** Famille des ''[[Tectivirus|Tectiviridae]]'' ** Genres non classés *** ''[[Mimivirus]]'' - exemple ''[[Acanthamoeba polyphaga mimivirus]]'' ====Groupe II - [[Virus à ADN à simple brin]]==== * [[bactériophage]]s non classés ** Famille des ''[[Inoviridae]]'' ** Famille des ''[[Microviridae]]'' * [[Virus]] non classés ** Famille des ''[[Geminiviridae]]'' ** Famille des ''[[Circoviridae]]'' ** Famille des ''[[Nanoviridae]]'' ** Famille des ''[[Parvoviridae]]'' - exemples ''[[virus de Norwalk]]'' ou ''[[Parvovirus B19]]'' (qui dépend d'une co-infection à [[adénovirus]] pour la croissance) ** Genres non classés *** ''[[Anellovirus]]'' - exemple ''[[Torque teno virus]]'' ===[[Virus à ARN]]=== ====Groupe III - [[Virus à ARN à double brin]]==== ** Famille des ''[[Birnaviridae]]'' ** Famille des ''[[Chrysovirus|Chrysoviridae]]'' ** Famille des ''[[Cystovirus|Cystoviridae]]'' ** Famille des ''[[Hypovirus|Hypoviridae]]'' ** Famille des ''[[Partitiviridae]]'' ** Famille des ''[[Reoviridae]]'' - exemples ''[[Rotavirus]]'' ou ''[[Orthoreovirus]]'' ** Famille des ''[[Totiviridae]]'' *Genres non classés ** ''[[Endornavirus]]'' - exemple ''[[Vicia faba endornavirus]]'' ====Groupe IV - [[virus à ARN simple brin à polarité positive]] (Virus (+)ssARN ou de type ARN messager)==== * Ordre des ''[[Nidovirales]]'' (Virus "nidifiés") ** Famille des ''[[Arteriviridae]]'' ** Famille des ''[[Coronaviridae]]'' - exemple ''[[Coronavirus]]'' ** Famille des ''[[Okavirus|Roniviridae]]'' * Non attribué ** Famille des ''[[Astroviridae]]'' ** Famille des ''[[Barnavirus|Barnaviridae]]'' ** Famille des ''[[Bromoviridae]]'' ** Famille des ''[[Caliciviridae]]'' - exemple ''[[virus de Norwalk]]'' ** Famille des ''[[Closteroviridae]]'' ** Famille des ''[[Comoviridae]]'' ** Famille des ''[[Dicistroviridae]]'' ** Famille des ''[[Flaviviridae]]'' - exemples ''virus de la [[fièvre jaune]]'', ''[[virus du Nil occidental]]'', ''virus de l'[[hépatite C]]'', ''virus de la [[dengue]]'' ** Famille des ''[[Flexiviridae]]'' ** Famille des ''[[Hepeviridae]]'' - exemple ''virus de l'[[hépatite virale|hépatite E]]'' ** Famille des ''[[Leviviridae]]'' ** Famille des ''[[Luteoviridae]]'' ** Famille des ''[[Marnavirus|Marnaviridae]]'' ** Famille des ''[[Narnaviridae]]'' - virus à ARN nus ** Famille des ''[[Nodaviridae]]'' ** Famille des ''[[Picornaviridae]]'' - exemples ''virus de la [[Poliomyélite]]'', ''[[Rhinovirus]]'', ''virus de l'[[hépatite A]]'', ''[[Coxsackie A virus]] et [[Coxsackie B virus]] '' ** Famille des ''[[Potyviridae]]'' ** Famille des ''[[Sequiviridae]]'' ** Famille des ''[[Tetraviridae]]'' ** Famille des ''[[Togaviridae]]'' - exemple ''[[Rubivirus]]'' (''virus de la [[rubéole]]'') ** Famille des ''[[Tombusviridae]]'' ** Famille des ''[[Tymoviridae]]'' ** Genres non classés *** Genre ''[[Benyvirus]]'' - exemple ''[[Beet necrotic yellow vein virus]]'' *** Genre ''[[Cheravirus]]'' - exemple ''[[Cherry rasp leaf virus]]'' *** Genre ''[[Furovirus]]'' - exemple ''[[Soil-borne wheat mosaic virus]]'' *** Genre ''[[Hordeivirus]]'' - exemple ''[[Barley stripe mosaic virus]]'' *** Genre ''[[Idaeovirus]]'' - exemple ''[[Raspberry bushy dwarf virus]]'' *** Genre ''[[Machlomovirus]]'' - exemple ''[[Maize chlorotic mottle virus]]'' *** Genre ''[[Ourmiavirus]]'' - exemple ''[[Ourmia melon virus]]'' *** Genre ''[[Pecluvirus]]'' - exemple ''[[Peanut clump virus]]'' *** Genre ''[[Pomovirus]]'' - exemple ''[[Potato mop-top virus]]'' *** Genre ''[[Sadwavirus]]'' - exemple ''[[Satsuma dwarf virus]]'' *** Genre ''[[Sobemovirus]]'' - exemple ''[[Southern bean mosaic virus]]'' *** Genre ''[[Tobamovirus]]'' - exemple ''[[virus mosaïque|virus de la mosaïque du tabac]]'' *** Genre ''[[Tobravirus]]'' - exemple ''[[Tobacco rattle virus]]'' *** Genre ''[[Umbravirus]]'' - exemple ''[[Carrot mottle virus]]'' ====Groupe V - [[virus à ARN simple brin à polarité négative]]==== *Ordre ''[[Mononegavirales]]'' (virus à polarité négative non-segmentés) ** Famille des ''[[Bornaviridae]]'' - ''[[Borna disease|Borna disease virus]]'' ** Famille des ''[[Filoviridae]]'' - exemple ''virus [[Ebola (virus)|Ebola]]'', ''virus de la [[Fièvre hémorragique de Marbourg]]'' ** Famille des ''[[Paramyxoviridae]]'' - exemples ''virus de la [[rougeole]]'', ''virus des [[oreillons]]'' ** Famille des ''[[Rhabdoviridae]]'' - exemples ''virus de la [[Rage]]'' *Virus à polarité négative segmentés ** Famille des ''[[Arenaviridae]]'' - exemples ''virus de la [[fièvre de Lassa]]'', ''virus Junin (fièvres d'Amérique du Sud)'' ** Famille des ''[[Bunyaviridae]]'' - exemple ''[[Bunyavirus]]'' ''[[Phlebovirus]]'' ''[[Hantavirus]]'' ** Famille des ''[[Orthomyxoviridae]]'' - virus de l'influenza A, B, et C (virus de la ''[[grippe]]'') **Genres non classés *** Genre ''[[Deltavirus]]'' - exemple ''virus de l'[[hépatite virale|Hépatite delta]]'' *** Genre ''[[Ophiovirus]]'' - exemple ''[[Citrus psorosis virus]]'' *** Genre ''[[Tenuivirus]]'' - exemple ''[[Rice stripe virus]]'' *** Genre ''[[Varicosaivirus]]'' - exemple ''[[Lettuce big-vein associated virus]]'' ===Virus à ADN ou à ARN à transcription inverse=== ====Groupe VI - rétrovirus à ARN simple brin==== *Famille ''[[Metaviridae]]'' *Famille ''[[Pseudoviridae]]'' *Famille ''[[Rétrovirus|Retroviridae]]'' - exemples ''[[VIH|VIH 1]]'', ''[[HTLV]]'' (''[[lymphome]]'') ====Groupe VII - Pararétrovirus à ADN double brin==== *Famille ''[[Hepadnaviridae]]'' - exemple ''virus de l'[[Hépatite B]]'' *Famille ''[[Caulimoviridae]]'' - exemple ''[[virus mosaïque|virus de la mosaïque du choux-fleur]]'' ==Classification par type de capside== Voir [[Capside]] ==Voir aussi== * [[Virus]] * [[Viroïde]] * [[Virusoïde]] * [[Provirus]] * [[Taxonomie]] * [[Classification scientifique]] * [[WikiSpecies:Virus|WikiSpecies:Virus (en anglais)]] ==Liens externes == * {{fr}} Principes actuels de [http://anne.decoster.free.fr/d1viro/vgclass.html classification des virus] * {{en}} Index alphabétique officiel [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/Ictv/index.htm des virus, d'après l'ICTV], International Committee on Taxonomy of Viruses * Base de données de Taxinomie : [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Taxonomy The NCBI Entrez Taxonomy Homepage] {{Portail|médecine|microbiologie}} [[Catégorie:Virus|*]] [[Catégorie:Classification scientifique]] [[da:Virus (biologi)]] [[de:Virusklassifikation]] [[en:Virus classification]] [[hu:A vírusok osztályozása]] [[ja:ウイルスの分類]] [[pl:Systematyka wirusów]] [[pt:Classificação dos vírus]] [[ro:Clasificarea virusurilor]] [[tr:Virüs sınıflandırması]] [[zh:生物病毒分類表]]