Classification scientifique des espèces 9541 31697717 2008-07-19T06:49:44Z ToePeu.bot 290412 robot Ajoute: [[el:Συστηματική ταξινόμηση]] Dans les [[biologie|sciences du vivant]], le terme de '''classification''' tantôt utilisé pour désigner la '''[[systématique]]''' courante, tantôt utilisé dans le sens de « classification biologique » au sens large pour désigner la suite de '''[[rang taxinomique|rangs taxinomiques]]''' qui, du [[Règne (biologie)|règne]] à l'[[espèce]], forment les étages de la pyramide accueillant les [[taxon]]s de la systématique d'un groupe donné. Les termes concernés ne bénéficient pas d'une définition unanimement admise. Chaque ouvrage scientifique, chaque dictionnaire et pour ainsi dire chaque auteur ayant la sienne. Comme écrivait Small (1989)<ref>in K.J. Sytsma et J.C. Pires, 2001, ''Taxon'' '''50''', p.726</ref> : « L'ironie est de constater que les spécialistes en classification biologique n'ont pas réussi à se doter d'une claire systématique et d'une claire nomenclature à l'intérieur de leur propre champ d'activité et de ses composants […] ». <!--== La science du concret == Le besoin de classer semble être lui-même un caractère inhérent à l'espèce humaine. {{référence souhaitée|Des psychologues ont observé que le nourrisson classe le monde en « bons suçables » et « mauvais suçables ».}} C'est par l'observation des organismes vivants et par leur comparaison que l’''Homo sapiens'' a défini des [[taxon]]s élémentaires (correspond souvent au [[Genre (biologie)|genre]] et à l'[[espèce]]), eux-mêmes classés dans un système. On dit alors qu'il « taxe le vivant ». --> == De la diversité des classifications == {| border="1" cellspacing="0" align="right" cellpadding="2" |- | align="center" bgcolor="e0d0b0" | '''classification classique''' |- {| border="0" cellspacing="0" align="right" cellpadding="2" |- | align="left" bgcolor="pink"| [[Règne (biologie)|Règne]] : [[Animal]] |- | align="left" bgcolor="lightgreen"| [[Règne (biologie)|Règne]] : [[Plante]] |- | align="left" bgcolor="lightblue"| [[Règne (biologie)|Règne]] : [[Champignon]] |- | align="left" bgcolor="khaki"| [[Règne (biologie)|Règne]] : [[Protiste]] |- | align="left" bgcolor="lightgrey"| [[Règne (biologie)|Règne]] : [[Bactérie]] |- | align="left" bgcolor="darkgray"| [[Règne (biologie)|Règne]] : [[Archéobactérie]] |} |} Le besoin de classer semble être lui-même un caractère inhérent à l'espèce humaine. C'est en comparant les organismes vivants que l’''Homo sapiens'' a défini des [[taxon]]s élémentaires (correspondant souvent au [[Genre (biologie)|genre]] et à l'[[espèce]]), eux-mêmes classés dans un système. Liée à une culture, à un état d'avancement des connaissances, toute classification évolue et varie avec l'évolution des sociétés elles-mêmes. En réalité, le découpage conceptuel varie avec chaque langue (y compris les langues de métier), chaque civilisation ou spécialité ayant tendance à surestimer l'objectivité de sa pensée classificatrice. De plus, alors que la société traditionnelle évolue peu, ou très lentement, c'est l'inverse pour les sociétés dites scientifiques, beaucoup plus versatiles et indépendantes les unes des autres. De ce fait découle la multiplicité de classifications. === Classification populaire === Première en date, c'est elle qui « primitivement » (et [[Nom vernaculaire|vernaculaire]]ment) a permis de distinguer les genres et les espèces. Elle conserve encore, de nos jours, son importance. Fondée sur des critères simples : l'apparence, les mœurs supposées, les cris, etc. elle ne s'embarrasse guère de données scientifiques. Devant l'inconnu, elle procède par extension et/ou assimilation : par exemple, la souris → la chauve-souris → le kiwi (couvert de poils, le kiwi était pour les chinois assimilable à une souris végétale…). Toutefois, le mécanisme universel de l'assimilation est basé sur une étape de l'observation se retrouve aussi dans la formation des noms scientifiques. La science des hommes n'étant, après tout, « qu'une suite d'erreurs... rectifiées » (Georges Becker). Culturellement, son étude comparée est des plus savoureuses (cf. par exemple les différents noms communs du coquelicot). Elle distingue de même, par exemple les hiboux des chouettes, les crapauds des grenouilles, les rats des souris ... toute espèces apparentées qui sont dans l'esprit d'un certain nombre, censées être ''maris et femmes''. Ainsi le hibou serait le mâle de la chouette, le crapaud celui de la grenouille, le corbeau celui de la corneille, etc. Bien sûr cela varie selon les langues et n’a, bien sûr, aucun sens en anglais (dans [[Tom et Jerry]], bien que ce soit ''une'' souris, Jerry est un ''mâle'', comme le confirment de nombreux épisodes). Certes, ''le côté naïf et spontané de ces croyances peut prêter à sourire'' ([[Konrad Lorenz|Lorenz]]) ou même agacer mais il serait vain, et même nuisible, d'en rire, surtout au nom de la Science (la connaissance). Car dans l'imaginaire populaire ces appellations ont une forte signification. Et comme a si bien su le dire [[Fleming]] : ''Pour que le plus grand nombre s'intéresse à la science, la science doit d'abord s'intéresser au plus grand nombre.'' === Classification « primitive » === La vision ethnocentrique qui préjuge d'une supériorité de l'homme moderne sur le primitif est invalidée par de très nombreux travaux comparatifs en [[anthropologie]] moderne. Ces études montrent en effet que, dans tous les cas où l'homme prétendu « primitif » ou sauvage (pour son économie de subsistance) est resté intégré à son milieu, son sens aigu d'observation et sa pleine conscience des rapports entre la vie animale et végétale, qui ne laissent pas d'étonner les scientifiques, constitue une science considérable! Ainsi, d'après [[Claude Lévi-Strauss]], les indiens [[Navaho]] distinguent plus de 500 plantes, les Hanunóo des îles [[Philippines]] classent les oiseaux en 75 catégories et divisent leur flore locale, au plus bas niveau, en plus de 1 800 taxons, alors que les botanistes distinguent pour la même flore moins de 1 300 espèces, d'un point de vue scientifique moderne! Par exemple, dans une population arriérée des [[îles Ryû-Kyû]], le botaniste [[Alexander Hanchett Smith|A.H. Smith]] rapporte que « même un enfant peut souvent identifier l'espèce d'un arbre d'après un menu fragment de bois et, qui plus est, le sexe de cet arbre selon les idées qu'entretiennent les indigènes sur le sexe des végétaux; et cela en observant l'apparence du bois et de l'écorce, l'odeur, la dureté et d'autres caractères du même ordre ». Les observations de ce type abondent. L'enseignement qu'on en retire est un rappel de l'évidence : quand on a la prétention de classer scientifiquement l'univers, il importe de recueillir de la façon la plus large possible, l'héritage de tous les classificateurs, qu'ils soient passés ou présents ou quelque soit leur niveau d'éducation. === Classification scientifique traditionnelle=== Continuellement enrichie depuis sa création princeps, la '''classification traditionnelle''' des espèces, actuellement obsolète mais encore très souvent utilisée est issue de celle de [[Carl von Linné|Linné]]. Elle divise le monde vivant en cinq règnes. Elle reste importante dans la mesure où elle imprègne encore de nombreux écrits, souvent récents, ainsi que certains manuels scolaires. En [[biologie]], la [[classification]] scientifique traditionnelle est telle que '''cinq règnes''' divisent le monde vivant : * les [[procaryote]]s ([[bactérie]]s et [[archaea|archées]]) ou [[cyanobactérie]]s dépourvues de noyau) * les [[protiste]]s ([[eucaryote]]s [[unicellulaire]]s) * les [[champignon]]s ([[eucaryotes]] [[pluricellulaire]]s [[hétérotrophe]]s qui décomposent) * les [[règne végétal|végétaux]] ([[eucaryotes]] [[pluricellulaire]]s, réalisant la [[photosynthèse]]) * les [[règne animal|animaux]] ([[eucaryote]]s [[pluricellulaire]]s [[hétérotrophe]]s qui ingèrent) La classification traditionnelle est basée sur des caractères multiples ([[biologie|biologiques]], [[phénotype|phénotypiques]], physiologiques). Dans de nombreux cas, le critère est la présence d'un caractère, s'opposant à son absence, considérée comme primitive (par exemple [[vertébré]]s et [[invertébré]]s). Mais les taxons définis par l'absence d'un caractère se sont révélés, à l'usage, très fragiles. La classification traditionnelle repose sur une hiérarchie fixe de catégories, définie de la façon suivante : :(vivant) → [[Règne (biologie) |règne]] → [[embranchement (biologie)|embranchement]] → [[classe (biologie)|classe]] → [[ordre (biologie)|ordre]] → [[famille (biologie)|famille]] → [[Genre (biologie)|genre]] → [[espèce]] À titre d'exemple, pour l'espèce humaine ([[homo sapiens sapiens]]) : :(vivant) → [[règne animal]] → embranchement des [[vertébré]]s → classe des [[mammifère]]s → ordre des [[primate]]s → famille des [[hominidé]]s → genre des [[homo]] → espèce [[homo sapiens]] === Classification classique === {{loupe|Classification classique}} La classification scientifique évolue actuellement, et dorénavant est nommée [[classification classique]], en tenant compte de certaines avancées en classification systématique phylogénétique (voir ci-dessous) Le terme embranchement est remplacé maintenant par division ou phylum, et la classification admet au dessus de ce niveau des sous-règnes, (ainsi que des super-divisions et sous-divisions en dessous). Au dessus du règne, on parle maintenant d'empire (bien que souvent non présenté dans les arbres phénétiques car implicite et largement documenté par ailleurs)&nbsp;: :(vivant) → (empire →) [[règne (biologie)|règne]] (→ [[sous-règne (biologie)|sous-règne]]) → [[division (biologie)|division]] → [[classe (biologie)|classe]] → [[ordre (biologie)|ordre]] → [[famille (biologie)|famille]] → [[Genre (biologie)|genre]] → [[espèce]] === Classification phylogénétique === {{loupe|classification phylogénétique}} Toutefois, parallèlement à la classification traditionnelle, s'est développée une [[classification phylogénétique]] basée sur le modèle évolutif et la notion d'ascendance commune. Cette nouvelle classification ne valide que des groupes [[monophylétique]]s et permet de mieux visualiser les embranchements du vivant constitués par différenciations successives au cours du [[temps]]. La hiérarchie fixe de catégories ([[espèce]], [[Genre (biologie)|genre]], [[Famille (biologie)|famille]], etc.) est abandonnée au profit d'un système de [[taxon]]s emboîtés dont le [[rang taxinomique]] n'est généralement plus spécifié. La classification traditionnelle en cinq [[Règne (biologie) |règne]]s a été ramenée - en l'état actuel des recherches - à 3 domaines du vivant : * Les [[eubactérie]]s sont des organismes unicellulaires à structure [[procaryote]] (leur matériel génétique n'est pas enfermé dans un noyau). Elles possèdent une paroi cellulaire constituée de [[peptidoglycane]]. * Les [[archée]]s sont des organismes unicellulaires à structure [[procaryote]]. Elles possèdent une paroi cellulaire constituée de lipides spécifiques. D'un point de vue écologique, ce sont souvent (mais pas toujours) des [[extrémophile]]s. * Les [[eucaryote]]s peuvent être [[unicellulaire]]s ou [[pluricellulaire]]s. Leur matériel génétique est enfermé dans un noyau délimité par une membrane ; ils possèdent des [[mitochondries]] ; la multiplication cellulaire a lieu par [[mitose]] ; l'ADN est divisé en [[chromosome]]s et ils présentent une reproduction de type sexuée. L'une et l'autre des classifications ayant leurs mérites et leurs limites, leur usage ''conjoint'' dans une systématique dite pragmatique (au quotidien) n'est donc pas absurde, dans la mesure de leur complémentarité. == Présentation formelle== La langue utilisée par les scientifiques pour décrire (diagnose originale) et nommer les [[taxon|espèces vivantes]] est le [[latin]]. Une [[espèce]] est désignée par un '''[[nom binominal|binôme]]'', combinant un nom de [[Genre (biologie)|genre]] commençant par une [[capitale et majuscule|majuscule]] suivi d'une épithète spécifique (entièrement en minuscules) et, autant que possible suivie de la [[citation d'auteurs en botanique|citation abrégée du nom de l'auteur (en botanique)]] ou [[Citation d'auteurs en zoologie|en entier (en zoologie)]] qui a le premier décrit l'espèce sous ce nom; le nom complet est en [[italique]]. Donnons un exemple pour chaque règne : * ''[[Homo sapiens]]'' Linnaeus, 1758 ; * ''[[Escherichia coli]]'' Escherich, 1885 ; * ''[[Amanita phalloides]]'' (Pers. : Fr.) Gray ; * ''[[Mus musculus]]'' Linnaeus, 1758 ; * ''[[Pulsatilla vulgaris]]'' Mill., 1754. Traditionnellement, et jusqu'à la fin du siècle dernier, les principales langues scientifiques étaient, à égalité : l'allemand, l'anglais, l'espagnol, le français et l'italien (les codes de nomenclatures, par exemple, étant simultanément édités en 5 langues officielles). Mais de nos jours, dans les publications et communications, l'[[anglais]] se positionne de plus en plus en concurrence avec le latin et tente même parfois de le supplanter… La progression hégémonique de l'anglais touche d'ailleurs tous les domaines, y compris la langue internationale officielle de la poste, qui était (depuis près de deux siècles) le français. === Terminaisons latines indiquant le [[rang taxinomique]] === La [[nomenclature (biologie)|nomenclature]] a établi une terminologie [[Code international de nomenclature botanique|codifiée]] qui permet, au vu de la seule terminaison (ou [[suffixe]]) d'un [[taxon]] quelconque, de savoir quel est son [[rang taxinomique]] dans la hiérarchie [[systématique]] : {|border="1" cellpadding="4" cellspacing="0" style="margin:0.5em 1em 0.5em 0;background:#f9f9f9;border:1px #aaa solid;border-collapse:collapse" |- !style="background:#f3f3f3"|Empire !style="background:lightgrey"|[[Procaryote]] !style="background:khaki" colspan="4"|[[Eucaryote]] |- !style="background:#f3f3f3"|[[Rang taxinomique|Rang]] \ [[Règne (biologie)|Règne]] !style="background:lightgrey"|[[Bactérie]] et [[Archée]]<br /><small>''[[Bacteria]]'' et ''[[Archaea]]''</small> !style="background:lightgreen"|[[Plante]]<br /><small>''[[Plantae]]''</small> !style="background:khaki"|[[Algue]]<br /><small>''[[Protista]]''</small> !style="background:lightblue"|[[Champignon]]<br /><small>''[[Fungi]]''</small> !style="background:pink"|[[Animal]]</small><ref>Pour le [[règne animal]], des suffixes par défaut sont seulement mis en place à partir du [[rang (zoologique)]] de [[superfamille (biologie)|superfamille]] (ICZN article 27.2).</ref><br /><small>''[[Animalia]]''</small> |- |style="background:#f2f2f2"|'''[[Embranchement (biologie)|Embranchement]]''', '''[[Division (biologie)|Division]]''' ou '''[[Phylum]]''' |align="center"| ... |align="center" colspan="2"| -phyta |align="center"| -mycota |align="center"| ... |- |style="background:#f2f2f2"|<small>[[Sous-embranchement]], [[Sous-division (biologie)|Sous-division]] ou [[Sous-phylum]] </small> |align="center"| ... |align="center" colspan="2"| -phytina |align="center"| -mycotina |align="center"| ... |- |style="background:#f2f2f2"|'''[[Classe (biologie)|Classe]]''' |align="center"| ... |align="center"| -opsida |align="center"| -phyceae |align="center"| -mycetes |align="center"| ... |- |style="background:#f2f2f2"|<small>[[Sous-classe (biologie)|Sous-classe]]</small> |align="center"| ... |align="center"| -idae |align="center"| -phycidae |align="center"| -mycetidae |align="center"| ... |- |style="background:#f2f2f2"|<small>[[Superordre (biologie)|Superordre]]</small> |align="center"| ... |align="center" colspan="2"| -anae |align="center"| ... |align="center"| ... |- |style="background:#f2f2f2"|'''[[Ordre (biologie)|Ordre]]''' |align="center" colspan="4"| -ales |align="center"| ... |- |style="background:#f2f2f2"|<small>[[Sous-ordre (biologie)|Sous-ordre]]</small> |align="center" colspan="4"| -ineae |align="center"| ... |- |style="background:#f2f2f2"|<small>[[Infra-ordre (biologie)|Infra-ordre]]</small> |align="center"| ... |align="center" colspan="2"| -aria |align="center"| ... |align="center"| ... |- |style="background:#f2f2f2"|<small>[[Superfamille (biologie)|Superfamille]]</small> |align="center"| ... |align="center" colspan="2"| -acea |align="center"| ... |align="center"| -oidea |- |style="background:#f2f2f2"|'''[[Famille (biologie)|Famille]]''' |align="center" colspan="4"| -aceae |align="center"| -idae |- |style="background:#f2f2f2"|<small>[[Sous-famille (biologie)|Sous-famille]]</small> |align="center" colspan="4"| -oideae |align="center"| -inae |- |style="background:#f2f2f2"|<small>'''[[Tribu (biologie)|Tribu]]'''</small> |align="center"| -eae |align="center" colspan="3"| -eae, ae |align="center"| -ini |- |style="background:#f2f2f2"|<small>'''[[Sous-tribu (biologie)|Sous-tribu]]'''</small> |align="center"| -inae |align="center" colspan="3"| |align="center"| -ina |- |style="background:#f2f2f2"|'''[[Genre (biologie)|Genre]]''' |align="center" colspan="5"| -us, -a, -um, -is, -os, -ina, -ium, -ides, -ella, -ula, -aster, -cola, -ensis, -oides, -opsis… |} Au-dessous du rang de genre, tous les '''noms de taxons''' sont appelés '''combinaisons'''. Bien qu'elles ne figurent pas dans ce tableau, la plupart reçoivent également une terminaison [[latin]]e plus ou moins codifiée selon les disciplines. On distingue plusieurs catégories de combinaisons : *Entre genre et espèce (sous-genre, section, sous-section, série, sous-série, etc.), les combinaisons sont '''infragénériques''' et '''[[Nom binominal|binominales]]''': nom de genre, puis après indication du rang, une épithète infragénérique, par exemple le [[cèpe]] appartient à la section « ''Boletus'' sect. ''Edules'' » ; *Au rang d'espèce, les combinaisons sont '''spécifiques''' et '''[[Nom binominal|binominales]]''' ; *Au dessous de l'espèce les combinaisons sont '''infraspécifiques''' et '''[[Nom binominal#Quand le binôme devient trinôme|trinominales]]'''. Les terminaisons de ces épithètes suivent les mêmes règles de syntaxe latine et d'exception que les [[épithète]]s spécifiques. Pour les détails, chaque discipline [[biologie|biologique]] ayant des [[nomenclature (biologie)|règles nomenclaturales]] sensiblement différentes, voir les articles suivants : * [[Rang (bactérien)]] * [[Rang (botanique)]] * [[Rang (zoologique)]] == Notes == <references/> <!--* The stem of a latin word may not be straightforward to deduce from the [[nominative]] form as it appears in the name of the genus. For example, Latin "homo" (human) has stem "homin-", thus [[Hominid]]ae, not "Homidae". nombreux autres exemples.--> == Voir aussi == === Articles connexes === * [[Classification APG]] (classification phylogénétique des angiospermes) * [[Classification phylogénétique]] * [[Taxinomie]] (et systématique) * [[Nom binominal]] * [[Règne (biologie)]] * [[Francisation des termes en latin scientifique]] === Liens externes === * [http://www.itis.gov/ ITIS : Integrated Taxonomic Information System (anglais)] * Base de données de Taxonomie : [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Taxonomy|The NCBI Entrez Taxonomy Homepage] * Histoire de la Classification des végétaux: [http://thierry.jouet.free.fr/Sommaire/etapesclassification.htm Les grandes étapes de la classification des végétaux] * [http://perezyvan.free.fr/Gabriel_Neve/PDFcours2006/TP2_2006.pdf Méthodes de Classification Phylogénétique.] {{Portail|Origine et évolution du vivant|Biologie}} [[Catégorie:Cognition]] [[Catégorie:Taxinomie]] [[Catégorie:Classification scientifique|*]] [[af:Wetenskaplike klassifikasie]] [[ang:Cræftlicu endebyrdung]] [[ar:تصنيف علمي]] [[bg:Класификация на организмите]] [[bs:Naučna klasifikacija]] [[ca:Classificació científica]] [[cs:Biologická klasifikace]] [[cy:Dosbarthiad gwyddonol]] [[da:Videnskabeligt artsnavn]] [[el:Συστηματική ταξινόμηση]] [[en:Biological classification]] [[eo:Biologia klasado]] [[es:Clasificación científica]] [[eu:Sailkapen zientifiko]] [[fa:طبقه‌بندی علمی جانداران]] [[fi:Tieteellinen luokittelu]] [[ga:Aicmiú eolaíoch]] [[gl:Clasificación científica]] [[he:מיון עולם הטבע]] [[hi:जीवों का वर्गीकरण]] [[hu:Rendszertan (biológia)]] [[io:Ciencala klasifikuro di speci]] [[is:Vísindaleg flokkun]] [[it:Classificazione scientifica]] [[ja:生物の分類]] [[ka:ბიოლოგიური კლასიფიკაცია]] [[ko:생물 분류]] [[lt:Mokslinė klasifikacija]] [[lv:Organismu klasifikācija]] [[mr:जैविक वर्गीकरण]] [[ms:Pengelasan biologi]] [[pl:Klasyfikacja biologiczna]] [[pt:Classificação científica]] [[ro:Clasificare ştiinţifică]] [[ru:Биологическая систематика]] [[scn:Classificazzioni scintìfica]] [[simple:Scientific classification]] [[sk:Vedecká klasifikácia]] [[sl:Znanstvena klasifikacija živih bitij]] [[sv:Vetenskapligt namn]] [[ta:அறிவியல் வகைப்பாடு]] [[th:การจำแนกชั้นทางวิทยาศาสตร์]] [[to:Fakafaʻafaʻahinga fakasaienisi]] [[tr:Bilimsel sınıflandırma]] [[uk:Біологічна класифікація]] [[ur:جماعت بندی]] [[vec:Clasificazsion sientìfega]] [[vi:Phân loại khoa học]] [[zh:生物分類法]] [[zh-min-nan:Seng-bu̍t-ha̍k ê hun-lūi]]