Haplotype 1092793 28203272 2008-04-03T12:07:30Z Badmood 4507 nouveau style de bandeau de portail, voir [[Wikipédia:Prise de décision/Bandeaux de portail]] Un haplotype est défini par l'ensemble des différents [[allèle]]s de gènes présents et génétiquement liés sur un même chromosome. L'ensemble des [[gènes]] situés sur un même [[chromosome]] et dont les allèles ségrègent ensemble lors de la [[meiose]] constituent un '''haplotype'''. Deux gènes situés sur un même chromosome mais dont la transmission simultanée des allèles à la descendance est aléatoire sont dits syntènes. L'étude familiale de ces transmissions avait permis (avant la biologie moléculaire) d'établir la distance qui séparait deux gènes sur un même chromosome. Cette distance était exprimée en pourcentage de recombinaison, dont l'unité était le centimorgan, en hommage au généticien [[Thomas Hunt Morgan|Morgan]]. Deux allèles qui ne se séparaient que dans 2% des cas lors de leur transmission aux enfants étaient distants de 2 centimorgans. Si leur transmission simultanée n'avait lieu qu'une fois sur deux, il s'agissait d'une transmission "au hasard", la distance était donc de 50 centiMorgans, ces gènes auxquels appartenainent ces allèles étaient dits indépendants. Le terme est essentiellement utilisé en [[immunologie]] pour désigner un ensemble de gènes liés situés sur un même [[chromosome]]. Ce groupe de gènes codant divers [[antigène]]s sanguins ou tissulaires. Les premiers systèmes de [[groupe sanguin|groupes sanguins]] définis par des haplotypes ont été les systèmes [[Groupe Rhésus|Rhésus]] en 1947, et MNS dont le lien entre l'antigène S et les groupes sanguins MN a été suspecté en 1947 et la description en haplotypes confirmée en 1951. Actuellement, le système le plus connu défini par des '''haplotypes''' est le complexe majeur d'histocompatibilité (système [[Human leukocyte antigen|HLA]]) dont le rôle est primordial dans la mise en œuvre des réactions de défense immunologique de l'organisme. De nombreuses [[maladie génétique|maladies génétiques]] trouvent leur origine dans une "anomalie" des gènes du système HLA. Supposons deux gènes liés sur un même chromosome, c'est à dire très proches l'un de l'autre et ne se séparant pas par crossing-over lors de la méïose. Par exemple dans le système de groupe sanguin MNS, sans considérer les nombreux variants mineurs de ce système, le gène codant une protéine, la glycophorine A (GPA), possède deux allèles M et N, et le gène codant une seconde protéine, la glycophorine B (GPB), possède deux allèles S et s. Il y a donc 4 '''haplotypes''' possibles dans ce système : ''MS'', ''Ms'', ''NS'', ''Ns''. Supposons un père ayant reçu de ses parents les haplotypes ''MS'' et ''Ns'' donc de génotype ''MS/Ns'' et de phénotype MNSs, marié à une femme homozygote ''MS/MS'' de phénotype MMSS. Leurs enfants seront nécessairement MS de par leur mère, et seront MS ou Ns de par leur père, mais ne pourront pas être Ms ou NS de par leur père. A moins d'une exceptionnelle recombinaison, dont la fréquence de survenue dans les familles donne un idée de la distance entre les gènes exprimée en centimorgans, les enfants MM seront nécessairement SS, et les enfants MN seront nécessairement Ss. {| class="wikitable" style="text-align:center; width:25%" |- !colspan="2" rowspan="2"| !!colspan="2"|Haplotypes maternels |- ! ''MS'' !! ''MS'' |- ! rowspan="2"|Haplotypes paternels!! ''MS'' | ''MS / MS '' || ''MS /MS'' |- ! ''Ns'' | ''MS / Ns'' || ''MS / Ns'' |} Ainsi, dans l'exemple précédent, sur 4 enfants, 2 sont MMSS, et deux MNSs. Si nous connaissons à l'origine les haplotypes paternels, nous concluons qu'il n'y a aucun recombinant. Si nous observions, dans cette famille un cinquième enfant qui serait MNSS (l'ensemble des autres marqueurs confirmant la paternité), ce serait un recombinant, et nous dirions que le pourcentage de recombinaison dans cette dernière famille est d'un enfant sur cinq, soit 20%. Si nous ne connaissons pas les haplotypes parentaux, la probabilité de recombinaison calculée n'est pas exactement la même du fait que les haplotypes parentaux sont déterminés à partir des enfants. Il fallait donc un grand nombre de familles (nombreuses de préférence) d'au moins deux enfants et/ou des familles étudiées sur trois générations, pour estimer, avant la biologie moléculaire, une distance exprimée en [[centiMorgan|centimorgans]]. {{Portail|Biologie cellulaire et moléculaire|médecine}} [[Catégorie:Génétique]] [[Catégorie:Immunologie]] [[Catégorie:Terme médical commençant par H]] [[ca:Haplotip]] [[cs:Haplotyp]] [[de:Haplotyp]] [[en:Haplotype]] [[es:Haplotipo]] [[ja:ハプロタイプ]] [[nl:Haplotype]] [[pl:Haplotyp]] [[pt:Haplótipo]] [[ru:Гаплотип]] [[sv:Haplotyp]]