Micro-organisme
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2008-06-26T17:57:16Z
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Intro (plus encyclopedique)
{{Projet:Traduction/Micro-organisme}}
[[Image:E coli at 10000x, original.jpg|thumb|[[Bactérie]] [[Escherichia coli]] grossie 10 000 fois au [[microscope électronique]].]]
[[Image:Escherichia coli (MCC).jpg|thumb|Culture d'Escherichia coli dans une [[boîte de Pétri]].]]
[[Image:SalmonellaNIAID.jpg|thumb|Salmonelles (Salmonella typhimurium), en rouge, sur une culture de cellules humaines.]]
Les '''micro-organismes''' ou ''microbes'' sont des [[organisme vivant|organismes vivants]] [[microscopique]]s. Ca veut dire, qu' inviduellement en principe ils sont invisibles à l'œil nu et ne peuvent être observés qu'à l'aide d'un [[microscope]].
Le terme ''microbe'' est un terme générique et non scientifique visant les [[bactérie]]s, [[levure]]s, [[protozoaire]]s, [[archaea]]s et [[virus]], pathogènes ou non.
Familièrement, le mot ''microbe'' désigne un micro-organisme (le plus souvent une bactérie ou un virus) responsable d'une maladie.
Depuis [[1872]] ([[Ferdinand Julius Cohn]]) les « [[bactéries]] » sont différenciées des [[levure]]s, des [[moisissure]]s, des [[Paramécie|infusoire]]s ou des [[parasite (médecine)|parasite]]s. Le mot microbe (littéralement ''petite vie'') a été introduit par le [[chirurgie]]n français [[Charles Sédillot]] en [[1878]] pour désigner tous ces êtres vivants infiniment petits, un mois avant que [[Louis Pasteur|Pasteur]] et ses collaborateurs fassent une communication à l'Académie de médecine, la '''Théorie des germes''' et ses applications à la [[médecine]] et à la [[chirurgie]], dans laquelle des êtres vivants microscopiques sont déclarés responsables de maladies : « Si j'avais l'honneur d'être chirurgien … » [[30 avril]] [[1878]]).
Les micro-organismes sont présents dans toute la structure de la [[taxonomie|taxonomique]]. Il est possible de distinguer d'une part les micro-organismes [[procaryote]]s qui ne possèdent pas de noyau comme les [[bactérie]]s et les [[Archaea]], et d'autre part les micro-organismes [[eucaryote]]s possédant un noyau. Les eucaryotes microscopiques comprennent les [[champignon]]s comme les [[levure]]s et les deux types de [[protiste]]s, [[algue]]s et [[protozoaire]]s.
Les micro-organismes sont souvent décrits comme unicellulaires quelques protistes unicellulaires sont visibles à l'œil nu et quelques espèces multicellulaires sont microscopiques.
La taille moyenne des cellules bactériennes est de 0,5 à 1 µm, mais il existe certaines bactéries ayant une taille de plus de 50 µm. Les cellules eucaryotes ont un diamètre allant de 5 à 20 µm.
Les micro-organismes unicellulaires étaient les [[origine de la vie|premières formes de vie]] à se développer sur Terre, il y a approximativement quatre milliards d'années.
En améliorant le microscope, [[Antoine van Leeuwenhoek]] permit la découverte des bactéries, il est le précurseur de l'étude des micro-organismes et de la [[biologie cellulaire]].
Les micro-organismes sont rencontrés dans tous les types d'environnement présent dans la nature, ils colonisent tous les [[écosystème]]s. Ils sont isolés du sol, des eaux douces et des eaux marines, de l'air, mais aussi d'environnement plus hostiles tel que les [[pôle]]s, les [[désert]]s, les [[geyser]]s, le fond des [[océan]]s. Les micro-organismes rencontrés dans des environnements extrêmes sont qualifiés d'[[extrémophile]]s. De nombreux micro-organismes sont associés aux [[plante]]s ou aux [[animal|animaux]] avec lesquels ils peuvent entretenir des relations de [[symbiose]], de [[commensalisme]] ou de [[parasitisme]]. Certains micro-organismes peuvent être [[pathogène]]s, c’est-à-dire entraîner une maladie chez les plantes ou les animaux.
== Besoins des micro-organismes ==
Les micro-organismes ont besoin, pour se nourrir de :
* substances organiques :
** glucides (sucres) : [[glucose]], [[lactose]]... apport de carbone et d'énergie.
Utilisation soit par respiration (dégradation totale : gaz), soit par fermentation (composés divers issus du « découpage » plus ou moins important des sucres.
Selon la nature des déchets, on peut distinguer :
:* la [[fermentation lactique]] : transformation du lactose en acide lactique par des ferments lactiques
:* la [[fermentation aromatique]] : (lactose)-citrates... transformés en produits aromatiques (diacétile...)
:* la [[fermentation alcoolique]].
Les produits de ces fermentations sont des déchets et sont donc rejetés dans le milieu.
* [[Protides]] : apport de substances azotées.
** Dégradation plus ou moins importante des protéines avec libération d'acides aminés, peptides, voire ammoniac : c'est la protéolyse.
* [[Lipides]] : éventuellement — apport de carbone et d'énergie.
** Libération d'acides gras : c'est la lipolyse.
** La quantité de lipides a un effet protecteur sur la destruction des bactéries par de hautes températures.
* substances minérales : sels
* facteurs de croissance : vitamines
* eau
Par le froid, on stoppe la croissance de la majorité des micro-organismes, qui vont se maintenir en état de dormance, sans multiplication.
L'importance du temps de chauffe permet, pour une température donnée, de parvenir à une destruction plus ou moins complète ; une augmentation de température impliquant une diminution du temps de chauffe.
Les principaux traitements thermiques sont la [[pasteurisation]] et la [[Stérilisation (microbiologie)|stérilisation]].
Quand, à une température favorable adaptée et optimale, on permettra le développement de certaines espèces :
* [[psychrophile]]s : température optimale de 12 à 15 °C
* [[psychrotrophe]]s : température optimale de 25 à 30 °C
* [[mésophile]]s : température optimale de 30 à 45 °C
* [[thermophile]]s : température optimale de 55 à 75 °C
L'interaction de micro-organismes différents peut varier :
* la [[métabiose]] : succession sur un même milieu de micro-organismes ; les premiers préparent le « terrain » pour les suivants, puis stoppent leur multiplication et enfin disparaissent.
* la [[symbiose]] : développement sur un même milieu et en même temps de plusieurs espèces microbiennes, ces espèces se favorisant mutuellement.
* l'antibiose : on en distingue plusieurs formes
** par compétition, lié au nombre et à la virulence d'une espèce ; la plus combative occupant le milieu, celui-ci devient impropre au développement de l'espèce la plus faible.
** par inhibition : les [[antibiotique]]s
** par parasitisme : les [[bactériophage]]s ou virus dont la multiplication est 25 à 100 fois plus rapide que celle des bactéries.
L'activité des micro-organismes dans la biosphère, leur rôle dans les [[cycle biogéochimique|cycles biogéochimiques]], est essentielle pour toute la vie sur Terre.
La [[microbiologie]] est la science qui étudie les micro-organismes.
==Recherche ==
* 2007. Une équipe de biologistes de l'Université du Massachusetts ([[États-Unis]]) a découvert un microbe se reproduisant à 121°C.
Trouvé proche d'une cheminée située dans les profondeurs de l'[[Océan Pacifique]], la "Souche 121" a survécu jusqu'à la température de 130°C. C'est l'organisme connu vivant sur terre résistant à la plus forte température.
Précédemment on connaissait [[Pyrolobus fumarii]] qui mourait après 1 heure d'incubation à 121°C.
== Notes et références ==
<references />
== Voir aussi ==
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=== Liens internes ===
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* [[Lutte antimicrobienne]]
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=== Liens externes ===
*{{fr}} [http://canal-educatif.fr/video2.html Vidéo sur la vie microbienne des eaux et la sélection naturelle]
=== Bibliographie ===
* Perry J., Staley J., Lory S. '''Microbiologie'''. Editions Dunod, 2004.
* Prescott, L.M., Harley, J.P. Klein, D.A., '''Microbiologie 2{{e}} édition''' DeBoeck eds, 2003.
* Singleton P. '''Bactériologie: Pour la médecine, la biologie et les biotechnologies'''. Cours, 6{{e}} édition, Dunod, 2005.
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