Phylogénomique 3144464 31753731 2008-07-21T10:24:01Z Frédéric Mahé 25515 Catégorisation, lien vers le portail ''biologie moléculaire'', lien vers l'article anglais. {{ébauche|biologie cellulaire et moléculaire}} La '''Phylogénomique''' désigne la rencontre de deux champs de recherche : la [[théorie de l’évolution]] et la [[génomique]]<ref>[http://www.biomedcentral.com/1471-2148/7/S1/S1 BioMed Central | Full text | Overview of the First Phylogenomics Conference<!-- Bot generated title -->]</ref>. Ce terme est employé dans plusieurs contextes différents mais désigne toujours une catégorie d'analyse impliquant des données génomique et de l'inférence évolutive, en particulier la reconstruction [[phylogénétique]]. Les différents contextes d'utilisation de la phylogénomique sont : * la prédiction de fonctions de gènes basée sur leur histoire évolutive ([[arbre phylogénétique]]). C'est sous cette forme que le terme a été employé pour la première fois<ref>Eisen JA, Kaiser D, Myers RL. 1997. Gastrogenomic delights: a movable feast. Nat Med. 3(10):1076-8. PMID 9334711]</ref>&nbsp;<ref>Eisen JA. 1998. Phylogenomics: improving functional predictions for uncharacterized genes by evolutionary analysis. Genome Res. 8(3):163-7. PMID 9521918]</ref>. Pour des approfondissements sur cet utilisation de la phylogénomique, consulter<ref>Brown D, Sjölander K. Functional classification using phylogenomic inference. PLoS Comput Biol. 2006 Jun 30;2(6):e77. PMID 16846248 </ref>&nbsp;<ref> Sjölander K. Bioinformatics. 2004 Jan 22;20(2):170-9. Phylogenomic inference of protein molecular function: advances and challenges. PMID 14734307 </ref> ; * la reconstruction phylogénétique par combinaison d'un grand nombre de gènes ou de génomes complets<ref> Delsuc F, Brinkmann H, Philippe H.Phylogenomics and the reconstruction of the tree of life. Nat Rev Genet. 2005 6(5):361-75.</ref>&nbsp;<ref> Philippe H, Snell EA, Bapteste E, Lopez P, Holland PW, Casane D. Mol Biol Evol. 2004 Sep;21(9):1740-52. Phylogenomics of eukaryotes: impact of missing data on large alignments.</ref>&nbsp;<ref>Jeffroy O, Brinkmann H, Delsuc F, Philippe H. Phylogenomics: the beginning of incongruence? Trends Genet. 2006 Apr;22(4):225-31. PMID 16490279</ref> ; * la fusion des données issues de l'analyse des génomes et de la reconstruction phylogénétique<ref>Eisen JA, Fraser CM. Phylogenomics: intersection of evolution and genomics. Science. 2003 Jun 13;300(5626):1706-7. PMID 12805538 </ref>&nbsp;<ref>Eisen JA, Hanawalt PC. A phylogenomic study of DNA repair genes, proteins, and processes. Mutat Res. 1999 Dec 7;435(3):171-213. PMID 10606811</ref>. == Origine == Le terme ''phylogénomique'' a été créé par [[Jonathan A. Eisen]] en 1997. == Références == <references/> {{Portail Biologie cellulaire et moléculaire}} [[Catégorie:Génétique]] [[en:Phylogenomics]]