Pseudomonas
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2008-06-07T20:44:39Z
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{{Taxobox bactérie | ''Pseudomonas'' | Pseudomonas_aeruginosa_gram.jpg | ''[[Pseudomonas aeruginosa]]'' <br />en [[coloration de Gram]] }}
{{Taxobox division | Proteobacteria }}
{{Taxobox classe | Gammaproteobacteria }}
{{Taxobox ordre | Pseudomonadales }}
{{Taxobox famille | Pseudomonadaceae }}
{{Taxobox genre bactérie (auteur) | Pseudomonas | [[Emil Friedrich August Walter Migula|Migula]], [[1894]]}}
{{Taxobox taxons bactérie |
* Voir texte.}}
{{Taxobox fin | microbiologie }}
Les [[bactérie]]s du [[Genre (biologie)|genre]] '''''Pseudomonas''''' peuvent être définies par :
* [[bacille (forme)|Bacilles]] à [[Gram négatif]], [[catalase]] + et [[oxydase]] variable (positive le plus souvent);
* [[aérobie strict|Aérobies stricts]] ;
* Dégradant le [[glucose]] par [[respiration aérobie]] ou inerte vis-à-vis du [[glucose]]. Ils n'attaquent pas les sucres ou les attaquent par [[voie oxydative]] et non fermentative ;
* Généralement mobiles ;
* Peu exigeantes, cultivant à 30 °C.
Ce [[genre (biologie)|genre]] comprend plus d'une centaine d'[[espèce]]s [[ubiquitaire]]s (dont l'[[espèce-type]] est ''[[Pseudomonas aeruginosa]]'' généralement dénommé ''[[Bacille pyocyanique]]'') cependant de nombreuses espèces sont en cours d'exclusion (de part les progrès de la [[phylogénétique]]) et réduire leur nombre à une soixantaine d'espèces.
==Habitat==
Ces bactéries, largement répandues dans l'environnement, vivent dans le sol et l'eau. Elles se retrouvent sur les plantes, dans les matières organiques non vivantes (denrées alimentaires), entraînant, parfois, leur altération [[organoleptique]]s.
Elles se rencontrent chez l'homme ou l'animal, au niveau des fosses nasales. Elles constituent, pour la plupart, une [[flore commensale]]. Certaines jouent un rôle pathogène :
*Chez les plantes (quelques espèces, dont ''[[Pseudomonas syringae]]'', dont une souche tue de jeunes marronniers par milliers depuis le début des années 2000)
*Chez l'homme et l'animal (avec principalement ''[[Pseudomonas aeruginosa]]'' )
Elles occupent des niches écologiques variées, mais se retrouvent plus particulièrement dans les milieux humides tels que les eaux douces, les eaux de mer, les eaux thermales. Elles se retrouvent en plus petite quantité dans les eaux riches en matières organiques (en particulier les eaux stagnantes) conséquence de la compétition entre microorganismes où les ''Pseudomonas'' ne sont pas les plus performants.
Dans les habitations humaines, elles se retrouvent dans les siphons d'évier et les réservoirs d'eaux de pluie qui, lorsque qu'elles sont utilisées pour l'arrosage des plantes, peuvent provoquer des maladies sur les plantes en particulier les fleurs (pour les espèces phytopathogène).
==Rôle pathogène==
Chez l'homme, l'espèce ''Pseudomonas aeruginosa'' (appelé aussi bacille pyocyanique) intervient fréquemment comme [[Pathogène|pathogène opportuniste]]. Elle se retrouve en flore de transit sur la peau et les muqueuse et cause des surinfections de plaies ou brûlures. Chez des individus [[immunodépression|immunodépressifs]] elle peut être la cause de diverses infections cutanées et viscérales voire même de [[septicémie]]. Elle comporte un risque particulièrement élevé d'[[infection nosocomiale|infections nosocomiales]] (contractées par l'intermédaire de soins en milieu hospitalier).
Les autres germes sont peu agressifs par eux-mêmes mais se comportent en général comme germes "opportunistes" profitant de conditions anormales d'implantation chez des individus débilités, créant des flores de substitution ou des infections graves par introduction accidentelle dans l'organisme (cathétérismes, baxter, sondages, etc...). Leur rôle a acquis plus d'importance au cours des dernières années, surtout en milieu hospitalier.
==Caractères bactériologiques==
===Morphologie microscopique===
'''Aspect''' : Les ''Pseudomonas'' sont des bacilles Gram négatifs fins droits et très mobiles grâce à un [[flagelle]] polaire : ciliature monotriche, dépourvus de spores et de capsules.
'''Groupement''' : Ils apparaissent la plupart du temps isolés ou en diplobacilles.
===Caractères de culture===
====Conditions de culture====
Les ''Pseudomonas'' sont des germes peu exigeants, l'immense majorité des espèces n'exigent aucun [[facteur de croissance]] et sont capables d'utiliser comme seule source de carbone et d'énergie un large spectre de substrats carbonés simples et variés.<br/>
Ils se développent sur tous les [[Milieu de culture|milieux]] usuels, même les plus simples.
Il possèdent aussi une grande tolérance dans les gammes de température environnante, bien qu'ayant une température optimale de croissance située entre 30 et 35°C ([[mésophile]]), elle sont capables de pousser à des températures entre 4 et 42°C en ralentissant leur [[métabolisme]]. Leur croissance n'est donc pas totalement entravée par les locaux réfrigérés et les incubateurs.
Elle résistent à de nombreux inhibiteurs bactériens, particulièrement aux agents chimiques. Elles continuent leur développement des certaines solutions antiseptiques (notamment le [[cétrimide]]) et sont [[résistance aux antibiotiques|résistantes à de nombreux antibiotiques]].
====Milieux de cultures utilisés====
*'''Milieux non sélectifs'''
**[[milieu ordinaire|Gélose ordinaire]]
**[[BCP (gélose lactosée au bromocrésol pourpre)|Gélose BCP]]
**[[Eau peptonée]]
*'''Milieux sélectifs'''
**[[Cétrimide (Gélose au)|Gélose cétrimide]]
**[[King A|Milieu de King A]]
**[[King B|Milieu de King B]]
===Caractères biochimiques===
====Métabolisme====
Toutes les espèces possèdent une [[oxydase]].
La dégradation du [[glucose]] s'effectue par la [[voie d'Entner-Doudoroff]], cette propriété est mise en évidence sur [[Hugh et Leifson|milieu Hugh-Leifson]]. Ils possèdent fréquemment une [[arginine dihydrolase]] permettant la dégradation de l'[[arginine]] en anaérobiose.
Certaines espèces peuvent extraire l'[[oxygène]] libéré par la réduction des [[nitrate]]s en [[azote]], et ainsi croître en anaérobiose ; on parle alors de ''"Respiration nitrate"''.
====Production de pigments====
De nombreux représentants de ce genre produisent un pigment. Citons ceux utilisés pour l'identification :
* La [[pyocyanine]], pigment bleu - vert phénazinique, il est soluble dans le [[chloroforme]] et l'[[eau]] et est spécifique de ''[[Pseudomonas aeruginosa|P. aeruginosa]]''.
* La [[pyoverdine]], vert fluorescent, soluble dans l'eau synthétisé par les ''Pseudomonas'' du groupe fluorescent.
==Espèces appartenant au genre ''Pseudomonas''==
{| width="100%" style="margin-left: 1em; font-size: 80%"
|- valign="top"
| width="25%" |
*Pseudomonas abietaniphila
*[[Pseudomonas aeruginosa]]
*Pseudomonas agarici
*Pseudomonas alcaligenes
*Pseudomonas alcaliphila
*Pseudomonas amygdali
*Pseudomonas anguilliseptica
*Pseudomonas antarctica
*Pseudomonas argentinensis
*Pseudomonas asplenii
*Pseudomonas aurantiaca
*Pseudomonas avellanae
*Pseudomonas azotifigens
*Pseudomonas azotoformans
*Pseudomonas balearica
*Pseudomonas beijerinckii
*Pseudomonas beteli
*Pseudomonas boreopolis
*Pseudomonas brassicacearum
*Pseudomonas brenneri
*Pseudomonas cannabina
*Pseudomonas carboxydohydrogena
*Pseudomonas caricapapayae
*Pseudomonas cedrina
*Pseudomonas cichorii
*Pseudomonas cissicola
*Pseudomonas citronellolis
| width="25%" |
*Pseudomonas congelans
*Pseudomonas corrugata
*Pseudomonas costantinii
*Pseudomonas cremoricolorata
*Pseudomonas extremorientalis
*Pseudomonas ficuserectae
*Pseudomonas flavescens
*Pseudomonas flectens
*[[Pseudomonas fluorescens]]
*Pseudomonas fragi
*Pseudomonas frederiksbergensis
*Pseudomonas fulva
*Pseudomonas fuscovaginae
*Pseudomonas gelidicola
*Pseudomonas geniculata
*Pseudomonas gessardii
*Pseudomonas graminis
*Pseudomonas grimontii
*Pseudomonas halodenitrificans
*Pseudomonas halophila
*Pseudomonas hibiscicola
*Pseudomonas indica
*Pseudomonas jessenii
*Pseudomonas jinjuensis
*Pseudomonas kilonensis
*Pseudomonas koreensis
*Pseudomonas libanensis
| width="25%" |
*Pseudomonas lini
*Pseudomonas lundensis
*Pseudomonas lutea
*Pseudomonas luteola
*Pseudomonas mandelii
*Pseudomonas marginalis
*Pseudomonas mediterranea
*Pseudomonas meliae
*Pseudomonas mendocina
*Pseudomonas mephitica
*Pseudomonas meridiana
*Pseudomonas migulae
*Pseudomonas monteilii
*Pseudomonas mosselii
*Pseudomonas mucidolens
*Pseudomonas multiresinivorans
*Pseudomonas nitroreducens
*Pseudomonas oleovoran
*Pseudomonas orientalis
*Pseudomonas oryzihabitans
*Pseudomonas otitidis
*Pseudomonas pachastrellae
*Pseudomonas palleroniana
*Pseudomonas panacis
*Pseudomonas parafulva
*Pseudomonas pertucinogena
*Pseudomonas pictorum
| width="25%" |
*Pseudomonas plecoglossicida
*Pseudomonas poae
*Pseudomonas proteolytica
*Pseudomonas pseudoalcaligenes
*Pseudomonas psychrophila
*Pseudomonas psychrotolerans
*Pseudomonas putida
*Pseudomonas resinovorans
*Pseudomonas rhizosphaerae
*Pseudomonas rhodesiae
*Pseudomonas salomonii
*Pseudomonas savastanoi
*Pseudomonas straminea
*Pseudomonas stutzeri
*Pseudomonas synxantha
*[[Pseudomonas syringae]]
*Pseudomonas taetrolens
*Pseudomonas thermotolerans
*Pseudomonas thivervalensis
*Pseudomonas tolaasii
*Pseudomonas tremae
*Pseudomonas trivialis
*Pseudomonas umsongensis
*Pseudomonas vancouverensis
*Pseudomonas veronii
*Pseudomonas viridiflava
*Pseudomonas xanthomarina
|}
'''Liste des espèces qui devraient être exclues du genre ''Pseudomonas'' :'''
{| width="100%" style="margin-left: 1em; font-size: 80%"
|- valign="top"
| width="25%" |
*Pseudomonas beijerinckii
*Pseudomonas beteli
*Pseudomonas boreopolis
| width="25%" |
*Pseudomonas carboxydohydrogena
*Pseudomonas chlororaphis
*Pseudomonas cissicola
| width="25%" |
*Pseudomonas flectens
*Pseudomonas geniculata
*Pseudomonas halophila
| width="25%" |
*Pseudomonas hibiscicola
*Pseudomonas mephitica
*Pseudomonas pictorum
|}
==Sources et références==
====Liens internes====
====Liens externes :====
* {{fr}} [http://www.bacterio.cict.fr/bacdico/pp/pseudomonadales.html L P S N]
* {{en}}http://www.genome.jp/kegg-bin/KEGG_Genome_map_top.pl?org_id=pae Génome de ''Pseudomonas aeruginosa PAO1'' (pointer sur la barre grise)]
'''Littérature :'''
{{portail microbiologie}}
[[Catégorie:Pseudomonadales]]
[[Catégorie:Bactérie (nom scientifique)]]
[[de:Pseudomonas]]
[[en:Pseudomonas]]
[[es:Pseudomonas]]
[[hr:Pseudomonas]]
[[it:Pseudomonas]]
[[tr:Pseudomonas]]
[[uk:Pseudomonas]]