Séquençage
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2008-03-31T09:17:27Z
Badmood
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{{ébauche|biologie cellulaire et moléculaire|biochimie}}
En [[biochimie]], le '''séquençage''' consiste à déterminer l'ordre linéaire des composants d'une [[macromolécule]] (les [[acide aminé|acides aminés]] d'une [[protéine]], les [[nucléotide]]s d'un [[acide nucléique]] comme l'[[Acide désoxyribo-nucléique|ADN]], les [[monosaccharide]]s d'un [[polysaccharide]], etc.).
En [[génétique]], le '''séquençage''' concerne la détermination de la séquence des [[gène]]s voire des [[chromosome]]s, voire du [[génome]] complet, ce qui techniquement revient à effectuer le séquençage de l'ADN constituant ces gènes ou ces chromosomes.
==Séquençage de l'ADN==
{{Article détaillé|Séquençage de l'ADN}}
Le séquençage de l'[[Acide désoxyribo-nucléique|ADN]], consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides d’un fragment d’ADN donné. Actuellement, la plupart du séquençage d’ADN est réalisée par la méthode de [[Frederick_Sanger|Sanger]]. Cette technique utilise la réaction de polymérisation de l’ADN avec une enzyme (anciennement le fragment de Klenow) "la sequenase" synthétisée complètement artificiellement et des didésoxyribonucléosides (ddNTP).
La séquence d’ADN contient l’information nécessaire aux êtres vivants pour survivre et se reproduire. Déterminer cette séquence est donc utile aussi bien pour les recherches visant à savoir comment vivent les organismes que pour des sujets appliqués. En médecine, elle peut être utilisée pour identifier, diagnostiquer et potentiellement trouver des traitements à des maladies génétiques. La biotechnologie est une discipline prospère avec des perspectives pour de nombreux produits et services utiles.
===Méthode de [[Frederick Sanger|Sanger]]===
Dans la méthode de Sanger, la polymérisation de l’[[Acide désoxyribonucléique|ADN]] est initiée par un petit oligonucléotide (amorce) complémentaire à une partie du fragment d’ADN à séquencer. L’élongation de l’amorce est réalisée par la « séquénase » (une [[ADN polymérase I]] dépourvue d’activités exonucléasiques 5’→3’et 3'→5', et 100 fois plus rapide que le fragment de Klenow). Les quatre désoxynucléosides (dATP, dCTP, dGTP, dTTP) sont ajoutés, ainsi qu’en faible concentration les quatre 2'-3'didésoxynucléosides (ddATP, ddCTP, ddGTP, ddTTP) marqués par des fluorochromes différents. Ces didésoxynucléosides, une fois incorporés à la nouvelle chaîne synthétisée, empêchent la poursuite de l’élongation. Il en résulte de nouveaux fragments d’ADN de taille variable, qui sont ensuite séparés par [[électrophorèse]] sur un gel de [[polyacrylamide]].
==voir aussi ==
[[Séquence biologique]]
===Séquençage du génome===
*[[séquenceur de gènes]]
*[[Projet génome humain]]
*[[Liste des génomes séquencés]]
== Séquençage des protéines ==
voir aussi : [[séquençage des protéines]]
== Séquençage des polysaccharides ==
A compléter ....
==Liens externes==
*[http://www.genoscope.cns.fr/externe/Francais/Questions/ Questions à propos du séquençage du génome humain]
*[http://www.infobiogen.fr/services/deambulum/fr/genomes5.html#ANNONCE Publications du séquençage du génome humain]
==Sources==
* [http://web.archive.org/web/2/infobiogen.fr - La Bio-informatique : Annexe {{{2}}}] ''(version [[Internet Archive|archivée]])'' (Le centre de ressources Infobiogen a cessé ses activités en juin 2006)
{{Portail|Biochimie|Biologie cellulaire et moléculaire}}
[[catégorie:Génétique]][[catégorie:Technique de biologie moléculaire]]
[[en:Sequencing]]
[[id:Sekuensing]]
[[it:Sequenziamento]]
[[ja:シークエンス]]
[[nl:Sequencing]]
[[pl:Sekwencjonowanie]]
[[ru:Секвенирование]]
[[uk:Секвенування]]
[[vi:Xác định trình tự]]