Virus de l'immunodéficience humaine
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2008-07-24T19:10:44Z
Luckas-bot
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robot Ajoute: [[cy:HIV]]
{{Taxobox virus | VIH (''HIV'') |Human_Immunodeficency_Virus_-_stylized_rendering.jpg | Schéma de la section d'un VIH }}
{{Taxobox groupe | {{virus Groupe VI}} }}
{{Taxobox famille | Retroviridae }}
{{Taxobox sous-famille | Orthoretrovirinae }}
{{Taxobox genre | Lentivirus }}
{{Taxobox espèce virus |
'''Virus de l'immunodéficience humaine''' :
* type 1 ('''VIH-1''')
* type 2 ('''[[VIH-2]]''')
}}
{{Taxobox fin}}
Le '''virus de l'immunodéficience humaine''' ('''VIH''', HIV en anglais) est un [[rétrovirus]] infectant l'[[Homo sapiens|homme]] et le conduisant à plus ou moins long terme au [[syndrome d'immunodéficience acquise]] (Sida), qui est un état affaibli du [[système immunitaire]] qui le rend vulnérable à de multiples [[Maladie opportuniste|infections opportunistes]].
Transmis par plusieurs fluides corporels : [[sang]], sécrétions vaginales, [[sperme]] ou [[lait maternel]], le sida est aujourd'hui considéré comme une [[pandémie]] ayant causé la mort d'environ 25 millions de personnes entre [[1981]] (date de la première identification de cas de sida) et janvier [[2006]]<ref>{{fr}} [http://www.unaids.org/en/HIV_data/2006GlobalReport/2006-GR_fr.asp ''2006 Rapport sur l'épidémie mondiale de SIDA'']</ref>. Il est estimé qu'environ 1 % des personnes âgées de 15 à 49 ans vivent avec le VIH, principalement en [[Afrique sub-saharienne]]<ref>{{fr}} [http://www.unaids.org/en/HIV_data/epi2006/default.asp ''Le point sur l'épidémie de sida''] en décembre 2006</ref>.
Bien qu'il existe des traitements [[Antirétroviral|antirétroviraux]] luttant contre le VIH et retardant par conséquence l'apparition du sida, réduisant ainsi la [[mortalité]] et la [[morbidité]], il n'existe à l'heure actuelle aucun [[Vaccination|vaccin]] ou traitement définitif. La prévention, qui passe notamment par les [[Sécuri-sexe|rapports sexuels protégés]] et la [[Test VIH|connaissance de son statut sérologique]] de manière à éviter les infections d'autrui, est le moyen de lutte le plus efficace.
==Histoire==
{{Voir aussi|Origine du virus de l'immunodéficience humaine}}
L'épidémie de sida est découverte le [[5 juin]] [[1981]] par le [[Centers for Disease Control and Prevention|CDC]] aux [[États-Unis]] après l'annonce d'une recrudescence dans les villes de [[Los Angeles]], [[San Francisco]] et [[New York]] de cas de [[pneumonie]]s à ''[[pneumocystis carinii]]'' et de [[Sarcome de Kaposi|sarcomes de Kaposi]]. Ces deux maladies ont pour particularité d'infecter les personnes [[Immunodépression|immunodéprimées]]. Il est justement remarqué que chez ces patients le taux de [[Cellule CD4+|lymphocytes T<sub>4</sub>]] est en chute libre et ces cellules jouent un rôle essentiel dans le [[système immunitaire]]. Les premiers malades sont tous [[Homosexualité|homosexuels]] ce qui fait que ce syndrome, qui ne portait pas encore le nom de sida, est appelé le ''syndrome gay'' ou ''cancer gay''. Une des premières causes suggérés de cette immunodépression est le [[poppers]], un [[vasodilatateur]] très utilisé chez les homosexuels <ref name="viro_hum_164">{{ouvrage
|éditeur=Masson
|titre=Virologie humaine
|auteur=Hervé J. A Fleury
|trad=fr
|année=[[2002]]
|pages=288
|isbn=2294008154
|lire en ligne=http://books.google.com/books?id=j0jZ4EUI8LwC&printsec=frontcover&hl=fr&output=text#PPA4164,M1
|chap=VIH-1 et VIH-2 - Historique
|passage=164}}</ref>. Mais dans les mois qui suivent, d'autres personnes sont infectées, des [[Toxicomanie|toxicomanes]] par injections, des [[Hémophilie|hémophiles]] et des [[Haïti|haïtiens]]. Cette découverte révèle que le poppers n'est pas la cause et une origine infectieuse est de plus en plus admise. Il reste alors à trouver l'agent infectieux.
L'origine virale est privilégiée, eu égard aux modes de transmission alors identifiés (sanguin et sexuel). Plusieurs virus sont mis en cause, mais on s'aperçoit qu'ils ne sont qu'une conséquence. [[Robert Gallo]] et son équipe, qui ont découvert le premier [[rétrovirus]] humain, le [[HTLV-1]], pensent qu'un [[Mutation (génétique)|mutant]] de ce dernier est la cause du Sida. Il explique cela par le fait que le HTLV-1 fait proliférer les lymphocytes T<sub>4</sub>, cet agent infectieux faisant l'inverse, une mutation peut en être la cause. Cet hypothèse est renforcée par le fait que certains de ces haïtiens sont positifs à un test de dépistage du HTLV-1. Cette positivité se révèlera être causé par un [[Biais de confirmation d'hypothèse|biais]], le HTLV-1 étant très présent à Haïti <ref name="viro_hum_164" />.
[[Image:LucMontagnier1995 065.jpg|right|180px|thumb|[[Luc Montagnier]] en [[1995]].]]
À partir de [[1982]], avec les premiers cas identifiés en [[France]], la recherche française débute. [[Willy Rozenbaum]], médecin à l'[[hôpital Bichat]] de [[Paris]], veut inciter les chercheurs à étudier plus en avant le Sida et en trouver la cause. Par l'entremise de [[Françoise Brun-Vezinet]], une collègue médecin, Willy Rozenbaum rencontre [[Jean-Claude Chermann]], [[Françoise Barré-Sinoussi]] et [[Luc Montagnier]] de l'unité d'[[oncologie]] virale de l'[[Institut Pasteur]]. Ces derniers acceptent de commencer les recherches et en janvier [[1983]], Willy Rozenbaum envoie un échantillon d'un patient atteint de [[lymphadénopathie]] qui est identifiée comme une maladie opportuniste du stade pré-Sida. L'échantillon est mis en culture et une activité de [[transcriptase inverse]] est identifiée, tendant à confirmer la présence d'un rétrovirus. Rapidement une [[apoptose]] apparaît, l'adjonction de [[Globule blanc|globules blancs]] à la mise en culture relance alors l'activité de transcriptase inverse. Un examen au [[microscope électronique]] a permis de visualiser pour la première fois le virus <ref name="pasteur_decouverte">{{fr}} {{Lien web
|url=http://www.pasteur.fr/ip/easysite/go/03b-00000j-0it/la-decouverte-du-virus-du-sida-en-1983
|titre= La découverte du virus du sida en 1983
|id= La découverte du virus du sida en 1983
|éditeur=[[Institut Pasteur]]
|consulté le={{date|9|juillet|2008}}
}}</ref>.
[[Image:RobertGalloMontreal1995 064.jpg|left|180px|thumb|[[Robert Gallo]] en [[1995]].]]
Après une prise de contact avec Robert Gallo pour un échange d'informations, l'équipe de l'Institut Pasteur confirme que le virus identifié chez le patient lymphadénopathique n'est pas le HTLV-1 <ref name="pasteur_decouverte" />. Ce nouveau rétrovirus est alors appelé ''Lymphadenopathy Associated Virus'' (LAV) et les résultats sont publiés dans ''[[Science magazine|Science]]'' le {{Date|20|mai|1983}}<ref>{{en}} [http://www.laskerfoundation.org/reports/pdf/isolation_retrovirus_1983a.pdf ''Isolation of a T-lymphotropic retrovirus from a patient at risk for acquired immune deficiency syndrome (AIDS)''], de Barre-Sinoussi F, Chermann JC, Rey F, Nugeyre MT, Chamaret S, Gruest J, Dauguet C, Axler-Blin C, Vezinet-Brun F, Rouzioux C, Rozenbaum W, Montagnier L</ref>. À ce stade le lien entre le LAV et le Sida n'est pas clairement établi par l'équipe de Luc Montagnier. L'équipe de Robert Gallo publie le {{date|4|mai|1984}} dans ''Science'' les résultats de l'isolement d'un virus qu'elle considère comme responsable du Sida et le nomme HTLV-3<ref>{{en}} [http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/224/4648/497 ''Detection, isolation, and continuous production of cytopathic retroviruses (HTLV-III) from patients with AIDS and pre-AIDS''], dans ''[[Science magazine|Science]]''</ref>. L'équipe de [[Jay A. Levy]] à [[San Fransisco]] fait de même le {{date|24|août|1984}} et trouve plusieurs [[rétrovirus]], qu'elle nomme ''AIDS-related virus'' (ARV)<ref>{{en}} [http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/225/4664/840?ijkey=50402d6415df96e004d05f3ead2e3384de838a63&keytype2=tf_ipsecsha ''Isolation of lymphocytopathic retroviruses from San Francisco patients with AIDS''], dans ''[[Science magazine|Science]]''</ref>. Pendant un temps, les trois dénominations cohabitent et une polémique a pendant un temps existé entre les équipes américaine et française concernant l'antériorité de la découverte<ref>{{en}} [http://www.thecrimson.com/article.aspx?ref=161833 ''Blinded By Science'']</ref>{{,}}<ref>{{en}} [http://query.nytimes.com/gst/fullpage.html?res=9F0CEFDA103DF932A05751C1A964958260&sec=health&spon=&pagewanted=1 '' Federal Inquiry Finds Misconduct By a Discoverer of the AIDS Virus'']</ref>.
Le LAV est étudié sous tous les aspects et plusieurs points sont alors démontrés, comme le fait qu'il est totalement différent du HTLV-1 qui est un [[oncovirus]] poussant les lymphocytes T à se multiplier, alors que le LAV les tue. Avec la coopération du CDC, l'équipe de l'Institut Pasteur renforce de plus en plus l'hypothèse que le VIH est la cause du Sida, ce qui est aujourd'hui considéré comme un fait par la communauté scientifique. En janvier [[1985]], le séquençage du LAV est réalisé par une équipe de l'Institut Pasteur qui publie ses résultats dans ''[[Cell (revue scientifique)|Cell]]''<ref>{{en}} [http://www.cell.com/content/article/abstract?uid=PII0092867485903034 ''Nucleotide sequence of the AIDS virus, LAV''], de Simon Wain-Hobson, Pierre Sonigo, Olivier Danos, Stewart Cole et Marc Alizon</ref>. C'est cette même année qu'il a été confirmé que les trois virus (LAV, HTLV-3 et ARV) étaient identiques.
Les premiers [[test VIH]] sont commercialisés durant l'année [[1985]] <ref name="pasteur_decouverte" />.
Le {{date|18|juillet|1986}}, les résultats de l'étude d'un patient venant d'[[Afrique de l'Ouest]] sont publiés dans ''Science'' par l'équipe de Luc Montagnier, en collaboration avec des médecins [[Portugal|portugais]]. Les examens ont permis d'identifier un nouveau type de LAV, le LAV-2<ref>{{en}} [http://www.laskerfoundation.org/reports/pdf/isolation_new_west_african_1986a.pdf ''Isolation of a new human retrovirus from West African patients with AIDS.''], de Clavel F, Guetard D, Brun-Vezinet F, Chamaret S, Rey MA, Santos-Ferreira MO, Laurent AG, Dauguet C, Katlama C, Rouzioux C, ''et al''.</ref>. Le séquençage du nouveau virus est réalisé l'année suivante, ainsi que la mise au point d'un test de dépistage.
En 1986, le LAV (ainsi que les autres dénominations) est officiellement renommé en virus de l'immunodéfience humaine (VIH), le LAV-1 devient VIH-1 et le LAV-2, le [[VIH-2]].
La communauté internationale prend conscience de la gravité de l'[[épidémie]] qui se transforme rapidement en [[pandémie]] et c'est ainsi que le {{Date|26|octobre|1987}} l'[[Assemblée générale des Nations unies]] vote une résolution invitant tous les États et toutes les agences [[Organisation des Nations unies|onusiennes]] à coopérer pour lutter contre cette pandémie<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://daccess-ods.un.org/TMP/8848974.html
|titre=Action préventive et lutte contre le syndrome d'immunodéficiance acquise
|id=Action préventive et lutte contre le syndrome d'immunodéficiance acquise
|date={{date|26|octobre|1987}}
|éditeur=[[Organisation des Nations unies]]
|consulté le={{date|30|novembre|2007}}
}}</ref>. Depuis la lutte contre le VIH/Sida est devenue une priorité pour l'ONU à travers son programme [[ONUSIDA|Onusida]], ainsi que nombre de gouvernements. La communauté scientifique est également très active en vue de mettre au point un vaccin, faisant du VIH le virus le plus étudié à ce jour.
Bien que l'[[Zidovudine|AZT]] ait été utilisé dès [[1986]] pour lutter contre le VIH, il faudra attendre le milieu des [[années 1990]] pour qu'arrivent sur le marché des traitements vraiment efficaces contre la réplication du VIH. Ces traitements, appelés [[trithérapie]]s, combinent plusieurs médicaments pour combattre le VIH sur plusieurs fronts à la fois. Le développement de tests biologiques permettant d'estimer la [[charge virale]] a grandement participé à l'efficacité de ces traitements, en permettant de modifier en conséquence la trithérapie pour la rendre la plus efficace possible.
==Structure==
[[Image:VIH sans libel.png|thumb|right|380px|Le virus de l'immunodéficience humaine]]
Le VIH est un [[rétrovirus]] du [[Genre (biologie)|genre]] des [[lentivirus]] qui se caractérisent par une longue [[période d'incubation]] et par voie de conséquence une évolution lente de la maladie (d'où la racine du nom venant du [[latin]] ''lenti'', signifiant lent).
Il est d'un aspect globalement sphérique pour un diamètre variant de 90 à 120 [[nanomètre]]s. Comme de nombreux virus infectant les [[Animal|animaux]], il dispose d'une enveloppe composée des restes de la [[Membrane (biologie)|membrane]] de la cellule infectée. Cette enveloppe est recouverte de deux types de [[glycoprotéine]]s : la première est la gp41 qui traverse la membrane, la seconde est la [[gp120]] qui recouvre la partie de la gp41 qui sort de la membrane. Une très forte liaison existe entre la gp120 et le [[Récepteur (biochimie)|récepteur]] des marqueurs [[CD4]] présent à la surface des [[Cellule CD4+|cellules CD4+]] du système immunitaire. C'est pour cette raison que le VIH n'infecte que des cellules ayant ce récepteur à leur surface, qui sont en très grande majorité les lymphocytes CD4+.
À l'intérieur de l'enveloppe se trouve une matrice protéique composée de protéines p17 et encore à l'intérieur la [[capside]] composée de protéines p24. C'est ce dernier type de protéines, avec gp41 et gp120, qui sont utilisés dans les [[Test VIH|tests VIH]] [[western blot]]. La [[nucléocapside]] est composée quant à elle de protéines p6 et p7.
Le génome du VIH, contenu dans la capside, est constitué d'un simple brin d'ARN en double exemplaire accompagné d'[[enzyme]]s qui :
* transcrivent l'ARN viral en ADN viral ([[transcriptase inverse]] p64)
* intègrent l'ADN viral à l'ADN cellulaire (l'[[intégrase]] p32)
* participent à l'assemblage du virus ([[protéase]] p10). Cette dernière n'est pas présente dans la capside, mais flotte dans la matrice p17.
Ces trois enzymes sont les principales cibles des traitements antirétroviraux, car elles sont spécifiques aux rétrovirus.
Le génome du VIH est composé de neuf gènes. Les trois principaux sont ''gag'', ''pol'' et ''env'' qui définissent la structure du virus et sont communs à tous les rétrovirus. Les six autres gènes sont ''tat'', ''rev'', ''nef'', ''vif'', ''vpr'' et ''vpu'' (ou ''vpx'' pour le [[VIH-2]]) qui codent des protéines régulatrices et dont les fonctions ne sont pas connues avec précision.
==Transmission==
{| class="prettytable droite" style="font-size:85%;"
|- bgcolor="#efefef"
! colspan="5"| Risque de transmission du VIH-1 selon la voie d'exposition<ref name=MMWR>{{en}}Smith, D. K., Grohskopf, L. A., Black, R. J., Auerbach, J. D., Veronese, F., Struble, K. A., Cheever, L., Johnson, M., Paxton, L. A., Onorato, I. A. and Greenberg, A. E. [http://www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtml/rr5402a1.htm#tab1 Antiretroviral Postexposure Prophylaxis After Sexual, Injection-Drug Use, or Other Nonoccupational Exposure to HIV in the United States], journal=MMWR, 2005, pages 1-20, volume=54, RR02</ref>
|- bgcolor="#efefef"
| align="center"|'''Voie d'exposition'''
| align="center"|'''Nombre de contaminations estimées<br/>pour {{formatnum:10000}} expositions<br/>à une source infectée'''
|-
| Transfusion sanguine
| align="center"| {{formatnum:9000}}<ref name=Donegan>{{en}}Donegan, E., Stuart, M., Niland, J. C., Sacks, H. S., Azen, S. P., Dietrich, S. L., Faucett, C., Fletcher, M. A., Kleinman, S. H., Operskalski, E. A., et al. Infection with human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) among recipients of antibody-positive blood donations. Ann. Intern. Med. 1990, pages 733-739, volume 113, issue 10, PMID 2240875</ref>
|-
| Accouchement
| align="center"| {{formatnum:2500}}<ref name=Coovadia>{{en}}Coovadia, H. Antiretroviral agents—how best to protect infants from HIV and save their mothers from AIDS, N. Engl. J. Med., 2004, pages 289-292, volume 351, issue 3, PMID 15247337</ref>
|-
| Partage de seringue chez des toxicomanes
| align="center" | 67<ref name=Kaplan>{{en}}Kaplan, E. H. and Heimer, R. HIV incidence among New Haven needle exchange participants: updated estimates from syringe tracking and testing data, J. Acquir. Immune Defic. Syndr. Hum. Retrovirol., 1995, pages 175-176, volume 10, issue 2, PMID 7552482</ref>
|-
| Rapport anal, réceptif<sup>*</sup>
| align="center"| 50<ref name=ESG>{{en}}European Study Group on Heterosexual Transmission of HIV, Comparison of female to male and male to female transmission of HIV in 563 stable couples, BMJ., 1992, pages 809-813, volume 304, issue 6830, PMID 1392708</ref>{{,}}<ref name=Varghese>{{en}}Varghese, B., Maher, J. E., Peterman, T. A., Branson, B. M. and Steketee, R. W., Reducing the risk of sexual HIV transmission: quantifying the per-act risk for HIV on the basis of choice of partner, sex act, and condom use, Sex. Transm. Dis., 2002, pages 38-43, volume 29, issue=1, PMID 11773877</ref>
|-
| Blessure percutanée par aiguille
| align="center" | 30<ref name=Bell>{{en}}Bell, D. M., Occupational risk of human immunodeficiency virus infection in healthcare workers: an overview., Am. J. Med., 1997, pages 9-15, volume 102, issue 5B, PMID 9845490</ref>
|-
| Rapport, pénis-vagin, réceptif<sup>*</sup>
| align="center"| 10<ref name=ESG />{{,}}<ref name=Varghese />{{,}}<ref name=Leynaert>{{en}}Leynaert, B., Downs, A. M. and de Vincenzi, I., Heterosexual transmission of human immunodeficiency virus: variability of infectivity throughout the course of infection. European Study Group on Heterosexual Transmission of HIV, Am. J. Epidemiol., year 1998, pages 88-96, volume 148, issue 1, PMID 9663408</ref>
|-
| Rapport anal, insertif<sup>*</sup>
| align="center"| 6,5<ref name=ESG />{{,}}<ref name=Varghese />
|-
| Rapport pénis-vagin, insertif<sup>*</sup>
| align="center"| 5<ref name=ESG />{{,}}<ref name=Varghese />
|-
| Fellation, réceptif<sup>*</sup>
| align="center"| 1<ref name=Varghese />
|-
| Fellation, insertif<sup>*</sup>
| align="center"| 0,5<ref name=Varghese />
|- bgcolor="#efefef"
! colspan="5"| <sup>*</sup> sans préservatif
|}
Le VIH est présent dans de nombreux fluides organiques. On en a retrouvé dans la [[salive]], les [[larme]]s et l'[[urine]], mais en des concentrations insuffisantes pour que des cas de transmission soient enregistrés. La transmissions par ces fluides est ainsi considérée comme négligeable. Par contre, des quantités assez importantes de VIH pour une infection ont été détectées dans le [[sang]], le [[lait maternel]], la [[cyprine (sécrétion)|cyprine]], le [[sperme]], ainsi que le liquide précédant l'[[éjaculation]]<ref>{{fr}} [http://anne.decoster.free.fr/d1viro/vtelechar/vpoly/hiv05.pdf ''Les rétrovirus''], page 13 et suivante, dans la section ''La transmission du VIH''</ref>.
Par voie de conséquence, les trois modes de contaminations sont :
* les [[Sécuri-sexe|rapports sexuels non protégés]], qu'ils soient [[Hétérosexualité|hétérosexuels]] ou [[Homosexualité|homosexuels]] représentent la part la plus importante des contaminations
* le contact avec du matériel contaminé chez :
** les [[toxicomanie|toxicomanes]] par injection
** les [[transfusion sanguine|transfusés]]
** le personnel de santé
* la transmission mère-enfant durant la [[grossesse]], pendant l'[[accouchement]] et lors de l'[[allaitement]]. Sans traitement et avec un accouchement naturel le taux de transmission varie, selon les études, entre 10 et 40 %<ref>{{fr}} [http://www.eao.chups.jussieu.fr/polys/viro/poly/viro.pdf ''Virologie''], page 121</ref>. C'est durant l'accouchement que les risques d'infection sont les plus élevés (65 % de tous les cas d'infection)<ref>{{fr}} [http://anne.decoster.free.fr/d1viro/vtelechar/vpoly/hiv05.pdf ''Les rétrovirus''], page 14, dans la section ''materno-fœtale''</ref>. Un traitement et la pratique d'une [[césarienne]] peuvent faire baisser ce chiffre à 1 %<ref>{{en}} [http://content.nejm.org/cgi/content/full/351/3/289 ''Antiretroviral Agents — How Best to Protect Infants from HIV and Save Their Mothers from AIDS''], de Hoosen Coovadia, dans le ''The New England Journal of Medicine'' du {{date|15|juillet|2004}}</ref>.
==Cycle de réplication==
Les cellules cibles du VIH sont celles présentant des récepteur CD4 à leur surface. Ainsi, les [[Cellule CD4+|lymphocytes T CD4+]], les [[macrophage]]s, les [[Cellule dendritique|cellules dendritiques]] et les [[Cellule gliale|cellules microgliales]] cérébrales peuvent être infectés par le VIH<ref>ce cycle de réplication est celui communément admis par la communauté scientifique, mais un groupe de chercheurs britanniques et américains contestent cette théorie et pensent que le VIH se reproduit en détruisant certains des globules blancs qui jouent le rôle de chef d'orchestre du système immunitaire. Voir l'article du quotidien ''[[Le Monde]]'' : [http://www.lemonde.fr/web/article/0,1-0@2-3244,36-927972@51-927973,0.html ''Le fonctionnement du sida remis en cause par des chercheurs''], du {{date|26|juin|2007}} et l'article original [http://medicine.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pmed.0040177 ''Understanding the Slow Depletion of Memory CD4+ T Cells in HIV Infection''], dans la revue ''[[PLOS Medicine]]''</ref>. Ainsi, la réplication virale a lieu dans plusieurs tissus.
La réplication du virus se déroule en plusieurs étapes :
[[Image:HIV attachment fr.png|thumb|right|440px|Processus d'attachement du VIH :<br />
1) Fixation de la gp120 au récepteur CD4
<br />
2) Fixation d'une boucle variable de la gp120 au co-récepteur et fixation de la gp41 sur la membrane cellulaire
<br />
3) Pénétration dans la cellule]]
;La fixation ou attachement à une cellule
Cette étape repose sur une reconnaissance entre les protéines de la surface virale gp120 et les récepteurs CD4 de la cellule cible. Après l'union avec un récepteur CD4, gp120 change de [[conformation]] et est attiré vers un co-récepteur devant également être présent à côté de la molécule CD4. Plus d'une dizaine de co-récepteurs ont été identifiés, mais les principaux sont CXCR4 pour les lymphocytes T CD4+ et CCR5 pour les macrophages<ref>{{en}} [http://www.niaid.nih.gov/daids/dtpdb/CELLTARG.asp ''Cellular Targets''], sur le site du [[National Institute of Allergy and Infectious Diseases]]</ref>.
;La fusion, la pénétration et la décapsidation
C'est la seconde étape de l'infection intervenant juste après l'union de gp120 avec le co-récepteur. Cette union libère la protéine gp41 qui se fixe sur la [[Membrane (biologie)|membrane cytoplasmique]]. Par repli sur elle-même, gp41 attire l'enveloppe virale vers la membrane cytoplasmique et la fusion des membranes cellulaire et virale a lieu grâce à un [[peptide]] de fusion présente dans gp41. La capside du VIH pénètre alors dans le [[cytoplasme]] de la cellule ; une fois à l'intérieur de la cellule, elle se désagrège, libérant les deux brins d'ARN et les enzymes qu'elle contenait.
Ainsi, la protéine gp120 est responsable de l'attachement et gp41 de la fusion puis de la pénétration au sein de la cellule.
{{clr}}
[[Image:HIV gross colored fr sans libel.png|thumb|320px|right|Cycle de réplication du virus de l'immunodéficience humaine]]
;La transcription inverse
Cette étape est spécifique aux rétrovirus. Ces derniers ayant pour génome de l'ARN et non de l'ADN, une opération de transcription, "convertissant" l'ARN viral en ADN viral est nécessaire, car seul de l'ADN peut être intégré dans le génome de la cellule cible. Cette transcription est réalisée par l'enzyme de [[transcriptase inverse]] (TI). La TI parcourt l'ARN viral et le transcrit en une première molécule d'ADN simple-chaîne, ou ADN brin(-). Pendant cette synthèse, l'ARN matrice est dégradé par une activité dite "RNAse H" portée par la TI. La dégradation de l'ARN est totale sauf pour deux courtes séquences riches en [[purine|purines]] appelées séquences PPT (polypurine tracts). Ces deux courtes séquences vont servir d'amorces à la TI pour la synthèse du second brin d'ADN, le brin(+), en utilisant l'ADN brin(-) comme matrice. L'ADN final est une molécule bicaténaire aussi appelée ADN à double-brin. Une particularité de la transcriptase inverse est de ne pas être fidèle dans sa transcription et de souvent faire des erreurs. C'est la raison pour laquelle le VIH a une très grande [[#Variants génétiques|variabilité génétique]].
;L'intégration
L'ADN bicaténaire pénètre dans le [[Noyau (biologie)|noyau cellulaire]] selon un processus actif encore mal compris. Cet import nucléaire constitue une particularité propre aux lentivirus qui sont de fait capables d'infecter des cellules en phase stationnaire, c'est-à-dire dont le noyau est intact. Pour ce faire, l'ADN bicaténaire est à ce moment du cycle étroitement associé à l'intégrase et d'autres composants protéiques viraux et cellulaires dans un complexe appelé complexe de pré-intégration. Ce complexe possède la capacité d'interagir avec des éléments de la membrane nucléaire pour traverser cette membrane et accéder à la chromatine cellulaire. L'ADN s'intègre ensuite au hasard dans le génome de la cellule cible sous l'effet de l'enzyme [[intégrase]].
;La formation d'un ARN messager
Les deux brins d'ADN de la cellule « s'écartent » localement sous l'effet de l'ARN polymérase. Des bases azotées libres du noyau viennent prendre la complémentarité de la séquence et se polymérisent en une chaîne monobrin : l'[[Acide ribonucléique messager|ARNm]] (messager).
;L'épissage
L'ARNm ainsi obtenu est hétérogène. En effet, il est constitué d'une succession d'[[intron]]s (parties non codantes) et d'[[exon]]s (parties codantes). Cet ARNm doit subir une maturation pour pouvoir être lu par les [[ribosome]]s. Se passe alors une excision des introns, pour ne laisser que les exons.
;La traduction de l'ARN
Une fois sorti du noyau par l'un des pores nucléaires, l'ARNm est lu par les ribosomes du RER ([[réticulum endoplasmique rugueux]]). L'ARNm vient en fait se glisser entre les deux sous-unités du ribosome. À chaque codon (groupe de trois nucléotides) de l'ARNm, le ribosome attribue un [[acide aminé]]. Les différents acides aminés se polymérisent au fur et à mesure de la lecture. Un codon initiateur AUG (Adénine-Uracile-Guanine) fera débuter la synthèse tandis qu'un codon stop (UAA ; UGA ; UAG) en marquera la fin.
;Maturation
Elle a lieu dans l'[[appareil de Golgi]] : les polypeptides ainsi formés ne sont pas encore opérationnels. Ils doivent subir une maturation dans l'appareil de Golgi.
;L'assemblage
Les protéines de structure du virus (matrice, capside et nucléocapside) sont produites sous forme de polyprotéines. Lorsqu'elles sortent du Golgi, les différentes protéines sont liées entre elles. Les protéines sont transportées à la membrane où elles rejoignent les glycoprotéines virales membranaires. Des ARN viraux rejoignent les protéines virales. Les protéines de structure s'assemblent pour former la capside et la matrice, englobant cet ensemble.
{{clr}}
[[Image:HIV-1 budding from cultured lymphocyte - TEM.jpg|thumb|200px|right|Bourgeonnement d'un virion sur un lymphocyte en culture]]
;Le bourgeonnement
La capside sort de la cellule infectée en arrachant une partie de la membrane cellulaire (à laquelle ont été préalablement fixées les protéines virales de surface (gp120 et gp41)).
;La maturation des virus
Une protéase virale doit couper les liens qui unissent les différentes protéines de structure (matrice, capside et nucléocapside) pour que les virions soient infectieux. Suite aux coupures, les virions sont prêts à infecter de nouvelles cellules.
{{clr}}
==Variantes génétiques==
[[Image:HIV-SIV-phylogenetic-tree.png|right|thumb|350px|[[Arbre phylogénétique]] du VIH et du [[Virus d'immunodéficience simien|VIS]]]]
Le VIH est un virus qui a une très importante variabilité génétique et présente ainsi une très grande diversité. Deux types ont été découverts :
* VIH-1, le plus présent dans le monde
* [[VIH-2]], moins contagieux que VIH-1. Il sévit principalement en [[Afrique de l'Ouest]]. Il comprend le VIH-2A et le VIH-2B.
Au sein de chaque type existent plusieurs groupes, qui à leur tour comportent des [[Clade|sous-types]].
Le VIH-1 est classé depuis [[1998]] en trois groupes<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://web.archive.org/web/20070126123215/http://www.pathexo.fr/pdf/Articles-bull/1999/1999n4/T92-4-GMI-7.pdf
|titre=Variabilité des virus de l'immunodéficience humaine de type 1
|id=Variabilité des virus de l'immunodéficience humaine de type 1
|auteur=F. Brun-Vézinet, F. Damond et F. Simon
|date={{date|13|octobre|1999}}
|page=2
|consulté le={{date|20|novembre|2007}}
}}</ref>, dont chacun correspondrait à des transmissions indépendantes de [[Virus de l'immunodéficience simienne|VIS]]<sub>cpz</sub> du chimpanzé à l'Homme<ref name="info viro page 5">{{fr}} {{Lien web
|url=http://www3.chu-rouen.fr/NR/rdonlyres/CA9D9E00-1F08-45C6-BE67-62151BF1FE7B/0/Informationsvirologiques.pdf
|titre=Informations virologiques
|id=Informations virologiques
|auteur=Jean-Christophe Plantier
|année=2005
|éditeur=CHU Rouen - Unité de Virologie
|page=5
|consulté le={{date|20|novembre|2007}}
}}</ref> :
* groupe M (pour ''major group'')
* groupe O (pour ''outlier group'')
* groupe N (pour ''non-M, non-O group'')
Le groupe M prédomine largement avec plus de 40 millions de personnes contaminées, contre un peu plus de 500 pour le groupe O et seulement 7 pour le groupe N<ref name="info viro page 5" />. Non seulement le groupe M est de loin le groupe le plus important en nombre de personnes contaminées, mais il est également celui qui est le plus répandu de par le monde en étant présent sur tous les continents alors que les deux autres groupes sont eux uniquement présents en [[Afrique centrale]]<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://www3.chu-rouen.fr/NR/rdonlyres/CA9D9E00-1F08-45C6-BE67-62151BF1FE7B/0/Informationsvirologiques.pdf
|titre=Informations virologiques
|id=Informations virologiques
|auteur=Jean-Christophe Plantier
|année=2005
|éditeur=CHU Rouen - Unité de Virologie
|page=7 et 8
|consulté le={{date|20|novembre|2007}}
}}</ref>.
Le groupe M comprend neuf sous-types ou [[clade]]s (de A à D, de F à H, J et enfin K). À cela s'ajoutent plusieurs formes recombinantes (en [[anglais]] ''circulating recombinant form'' ou CRF), qui ont pour origine la multiple infection d'une cellule par des sous-types différents, ce qui entraîne des mélanges dans le génome viral.
Les sous-types et formes recombinantes du groupe M ne sont pas réparties uniformément sur toute la planète. Ainsi, en Europe, dans les Amériques et en Australie c'est le sous-type B qui est le plus présent, alors qu'en Afrique c'est selon les régions le A et le C et en Asie, toujours selon les régions, les groupes C et E<ref>{{en}} {{Lien web
|url=http://www.jaids.com/pt/re/jaids/abstract.00126334-200202010-00013.htm
|titre=Estimated Global Distribution and Regional Spread of HIV-1 Genetic Subtypes in the Year 2000
|id=Estimated Global Distribution and Regional Spread of HIV-1 Genetic Subtypes in the Year 2000
|auteur=Saladin Osmanov, Claire Pattou, Neff Walker, Bernhard Schwardlander, Jose Esparza, and the WHO-UNAIDS Network for HIV Isolation and Characterization
|date={{date|1er|février|2002}}
|éditeur=Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes
|consulté le={{date|20|novembre|2007}}
}}</ref>.
Bien que la variabilité génétique au sein d'un même groupe ne semble pas modifier de manière significative la pathogénicité et la progression de l'infection, elle pose tout de même de sérieux problèmes pour la mise au point d'un [[Vaccination|vaccin]] efficace sur tous les groupes et souches du VIH, pour les mesures de la charge virale et dans certains cas particuliers de [[test VIH]]<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://web.archive.org/web/20070126123215/http://www.pathexo.fr/pdf/Articles-bull/1999/1999n4/T92-4-GMI-7.pdf
|titre=Variabilité des virus de l'immunodéficience humaine de type 1
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|auteur=F. Brun-Vézinet, F. Damond et F. Simon
|date={{date|13|octobre|1999}}
|page=3
|consulté le={{date|20|novembre|2007}}
}}</ref>. Dans ce dernier cas, c'est ainsi que les tests de dépistage basés sur des antigènes du VIH-1 de sous-type B et du VIH-2 de sous-type A, peuvent présenter une sensibilité moindre pour la reconnaissance des autres sous-types, particulièrement lors de la primo-infection ou d'infection par des variants comme les VIH-1 du groupe O<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://www.inist.fr/IMG/pdf/depistage.pdf
|titre=Dépistage du VIH/sida chez la femme à risque
|id=Dépistage du VIH/sida chez la femme à risque
|auteur=Claire Criton et Patricia Fener
|année=[[2007]]
|mois=mai
|éditeur=[[Centre national de la recherche scientifique]]
|page=10
|consulté le={{date|17|octobre|2007}}
}}</ref>.
===Origine de la variabilité===
L'apparition de nouvelles variantes génétiques est due à un processus d'[[Évolution (biologie)|évolution]], dont les mécanismes sont semblables à ceux qui expliquent l'évolution de toute espèce vivante. La seule différence est que l'évolution du VIH est extrêmement rapide, ce qui a conduit au grand nombre de variantes actuelles. On explique cette grande variabilité génétique du VIH par plusieurs causes :
;Des mutations aléatoires fréquentes
Chez les VIH, le taux de [[Mutation (génétique)|mutations]] est trés important : plus de mille fois plus important que dans le génome d'un humain. En voici les raisons :
* la [[transcriptase inverse]], qui permet au VIH de se répliquer, est une enzyme ne possédant pas de mécanisme de détection des erreurs de transcription. Les erreurs sont donc fréquentes et ont été estimées à une tous les {{formatnum:1700}} à {{formatnum:10000}} [[nucléotide]]s produits. Comme le génome du VIH est composé d'un peu moins de {{formatnum:10000}} nucléotides, il y a approximativement entre une et 10 mutations à chaque cycle viral<ref name="cours_retrovirus_section_variation_des_gènes">{{fr}} [http://anne.decoster.free.fr/d1viro/vtelechar/vpoly/hiv05.pdf ''Les rétrovirus''], dans la section ''La variation prend naissance au niveau des gènes'', page 11</ref>{{,}}<ref name="Cours_virologie_section_4.2.2.2">{{fr}} [http://www.eao.chups.jussieu.fr/polys/viro/poly/viro.pdf ''Virologie], dans la section ''La transcriptase inverse ou rétrotranscriptase (RT)'', page 119</ref>{{,}}<ref>Preston BD, Poiesz BJ, Loeb LA. Fidelity of HIV-1 reverse transcriptase. Science. 1988 Nov 25;242(4882):1168–1171. [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=PubMed&cmd=Retrieve&list_uids=2460924 PubMed]. ''Error rates : 1/2000 to 1/4000, 5 to 10 errors per HIV-1 genome per round of replication ''in vivo''.''</ref>{{,}}<ref>Roberts JD, Bebenek K, Kunkel TA. The accuracy of reverse transcriptase from HIV-1. Science. 1988 Nov 25;242(4882):1171–1173. [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=PubMed&cmd=Retrieve&list_uids=2460925 PubMed]. ''Average error rate of 1/1700''.</ref>{{,}}<ref>Diaz L, Destefano JJ. Abstr Gen Meet Am Soc Microbiol. 1998 May 17-21; 98: 493 (abstract no. T-16). Univ. of Maryland, College Park, USA. Fidelity of processive DNA synthesis by HIV-1 reverse transcriptase. [http://gateway.nlm.nih.gov/MeetingAbstracts/102226572.html Abstract]. ''1 error every 7500 bases copied''.</ref>
* le nombre important de [[virion]]s produits, qui est de l'ordre de {{formatnum:10000}} par jour pour chaque virions infectant une cellule<ref name="cours_retrovirus_section_variation_des_gènes" />. Au sein de l'organisme entier, tous les deux jours, de 10<sup>9</sup> à 10<sup>10</sup> virions sont renouvelés<ref name="Cours_virologie_section_4.2.2.2" />. En théorie, on peut donc prévoir que chacun de ces nouveaux virions porte des mutations différentes.
Ainsi, dans un seul organisme infecté il y a déjà plusieurs variantes génétiques, représentant ainsi une [[quasi-espèce virale]].
La variabilité du génome viral n'est pas la même pour tous les gènes, certains sont plus enclins à varier que d'autres. C'est ainsi que le gène ''env'' est le plus variable (c'est justement lui qui code les protéines de surface gp41 et gp120) alors que le gène ''pol'' est le plus conservé<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://web.archive.org/web/20070126123215/http://www.pathexo.fr/pdf/Articles-bull/1999/1999n4/T92-4-GMI-7.pdf
|titre=Variabilité des virus de l'immunodéficience humaine de type 1
|id=Variabilité des virus de l'immunodéficience humaine de type 1
|auteur=F. Brun-Vézinet, F. Damond et F. Simon
|date={{date|13|octobre|1999}}
|page=1
|consulté le={{date|20|novembre|2007}}
}}</ref>.
;Les recombinaisons génétiques
Lorsqu'une cellule est infectée par deux virions génétiquement différents, les séquences peuvent se [[Recombinaison génétique|recombiner]], ce qui donne naissance à des formes recombinantes. Ce processus, aléatoire, est favorisé par les comportements à risque parce qu'ils augmentent la probabilité de contaminations multiples chez une même personne.
;Sélection
Il y a ensuite un processus de [[sélection naturelle]]. Les erreurs de transcription et les recombinaisons produisent de nombreux virions différents les uns des autres. La plupart de ces mutations entraînent la production de virions incapables de se répliquer correctement, ce qui les destine à disparaître. Cette importante disparition de virions est compensée par le grand nombre de virions produits. Parmi les virions survivants, certains ont pour particularité d'être plus résistants aux attaques des défenses immunitaires. Cela a pour conséquence de les rendre mieux adaptés à leur milieu et finalement seuls les virions résistants sont présents dans l'organisme. Cela mène, à plus ou moins court terme, à une inefficacité des défenses immunitaires ce qui provoque l'état [[Immunodépression|immunodéprimé]] de l'organisme si le taux de lymphocytes CD4+ est trop bas.
La prise d'un traitement médicamenteux par les patients infectés par le VIH entraîne également une [[sélection naturelle|sélection]] au sein de la population virale. Ceci favorise la transmission des [[virion]]s mutants les plus résistants aux médicaments. Pour contrer cet adaptation des VIH, les multithérapies visent à « attaquer » le VIH sur plusieurs facettes à la fois, et ainsi limiter les possibilités du virus de s'adapter à son milieu.
;Origines multiples
Plusieurs passages du VIS<sub>cpz</sub> à l'Homme est la raison de l'existence des différents groupes du VIH-1. Ce qui est de même pour le VIH-2, dont l'ancêtre est le VIS<sub>smm</sub>.
== Diagnostic et suivi infectieux==
{{Article détaillé|Test VIH}}
Le diagnostic précoce de l'infection par le VIH est important pour une bonne prise en charge du VIH/Sida. En [[France]], par exemple, un cas sur deux est détecté au moment du stade Sida, ce qui, pour les cas non détectés, multiplie par seize le risque de décès du patient dans les six premiers mois de son traitement<ref>{{fr}} [http://www.eao.chups.jussieu.fr/polys/viro/poly/viro.pdf ''Virologie''], dans la section ''Indications des examens'', page 126</ref>.
Dans les pays développés, des tests sont pratiqués systématiquement pour les [[Don de sang|dons de sang]], d'[[Don d'organe|organes]] et de [[Don de sperme|sperme]]. Le manque de test a entraîné plusieurs contaminations de masses<ref>comme en France dans les [[années 1980]] avec l'[[Affaire du sang contaminé]] et en [[République de Chine|Chine]] dans les [[années 1990]].</ref>.
Le diagnostic [[Sérologie|sérologique]] est un acte médical réalisé, en France, par un médecin.
===Diagnostic===
Le diagnostic visant à déterminer le statut [[Sérologie|sérologique]] au VIH est réalisé en deux étapes :
* le '''[[dépistage]]''', dans la méthode de référence cela passe par une détection des anticorps anti-VIH
* la '''confirmation''' que les [[anticorps]] détectés sont bien liés à une infection par le VIH
La première étape se base sur la détection d'anticorps produits en réponse à une infection par le VIH, ce sont les anticorps anti-VIH. Cette production d'anticorps peut être détectée avec les moyens actuels en moyenne 22 jours après la contamination<ref>{{fr}} [http://anne.decoster.free.fr/d1viro/vtelechar/vpoly/hiv05.pdf ''Les rétrovirus''], dans la section ''Le diagnostique biologique - L'apparition des anticorps demande un certain temps…'', page 16</ref>. Durant cette période, appelée fenêtre sérologique, le patient est parfaitement infectieux, ce qui pose des problèmes évidents de [[santé publique]]. Une fois la fenêtre sérologique passée, son statut sérologique peut être établi.
La première étape de détection emploie la méthode [[Enzyme-linked immunosorbent assay|ELISA]], qui utilise la réaction anticorps-antigène pour détecter la présence des anticorps anti-VIH. Pour éviter les faux négatifs et ainsi ne pas passer à côté d'un cas de séropositivité, le test doit avoir une [[Sensibilité (statistique)|sensibilité]] optimale. Un mélange d'[[antigène]]s viraux est alors utilisé, permettant la détection des anticorps anti-VIH-1 et anti-VIH-2 (on parle alors d'ELISA mixte). L'utilisation de deux tests commerciaux d'origine différentes est généralement effectuée pour éliminer le maximum de faux positifs dès la première étape.
Si la détection se révèle positive, douteuse, ou discordante<ref>la détection discordante ne s'entend que dans le cas de double test</ref>, une confirmation est réalisée. Cette dernière vise à savoir si les anticorps détectés sont bien liés à une infection par le VIH-1. Pour cela on utilise une méthode [[Spécificité (statistique)|spécifique]], dont le but est d'éliminer les résultats faussement positifs. C'est la méthode [[western blot]] (WB) qui est généralement utilisée.<!-- (à déplacer dans l'article Test VIH) Méthode spécifique oblige, les antigènes viraux sont séparés et doivent détecter au moins deux des trois glycoprotéines virales (gp160, gp120 ou gp41) ou la protéine p24 et la glycoprotéine gp160 (qui dénote un début de séroconversion).--> Là encore, si le test est douteux ou dénote un début de séroconversion, un second test de confirmation est réalisé trois semaines plus tard, le temps que la séroconversion soit complète.<!-- (à déplacer dans l'article Test VIH) A la suite de ce test, trois cas se présentent :
* confirmation de la séroconversion au VIH-1
* séropositivité au VIH-2 (qui doit être à nouveau confirmé par un test spécifique au VIH-2)
* réaction non liée au VIH (ce qui arrive dans la plus part des cas)-->
Ce n'est qu'à la suite de l'ensemble des ces tests qu'un médecin pourra déclarer un patient séropositif.
====Autres méthodes====
Il existe d'autres techniques de détection d'une infection par le VIH<ref>{{fr}} [http://anne.decoster.free.fr/d1viro/vtelechar/vpoly/hiv05.pdf ''Les rétrovirus''], dans la section ''Autres tests pour le diagnostic biologique'', page 18 et 1</ref>, comme :
* l'antigénie p24 : utile lorsque la séroconversion n'a pas encore eu complètement lieu. Le test devient négatif une fois la séroconversion effectuée, cela explique donc l'utilisation de la procédure précédemment décrite comme un standard
* la méthode combinée : qui utilise l'antigénie p24 et la détection d'anticorps. Cette méthode est intéressante au tout début de la contamination, car elle réduit la fenêtre sérologique jusqu’à deux à cinq jours, tout en assurant la prise en compte des personnes totalement séroconvertis
* l'isolement en culture : utilisé pour les nouveau-nés de mère séropositive, car ces derniers sont obligatoirement séropositifs, les anticorps de la mère ayant été transmis. L'infection est confirmée lorsqu'une activité de transcriptase inverse est détectée ou bien des antigènes p24.
* la détection de l'ARN viral : on cherche les gènes ''gag'' ou ''pol'' du VIH. Cette méthode tend à remplacer la méthode d'isolement par culture pour les nouveau-nés
===Suivi infectieux===
Une fois la séropositivité établie, un suivi régulier de l'infection doit être effectué pour assurer une bonne prise en charge de la maladie et ainsi évaluer au mieux l'état du malade. Deux facteurs sont pris en compte :
* le taux de [[Cellule CD4+|lymphocytes T<sub>4</sub>]], pour définir le niveau de l'infection
* la charge virale, indiquant le nombre de virions dans l'organisme, par voie de conséquence la vitesse de réplication du VIH dans l'organisme et ainsi permettant de prédire l'évolution de l'infection
Le taux de lymphocytes T<sub>4</sub> mesure le déficit immunitaire occasionné par la présence du VIH. Cette numération correspond au nombre de cellules T<sub>4</sub> présentes dans le sang. Un taux normal chez l'Homme se situe entre 600 et {{formatnum:1200}} T<sub>4</sub>/mm{{3}}. On considère<ref>{{fr}} [http://www.sante.gouv.fr/htm/actu/yeni_sida/rapport_experts_2006.pdf ''Recommandations 2006 du groupe d'experts du Ministère français de la Santé''], dans la section ''Traitement antirétroviral'', page 22 et suivantes</ref> que :
* jusqu’à 500/mm{{3}} le patient peut vivre dans des conditions normales et ne nécessite pas de traitement
* à partir de 350/mm{{3}} le patient doit absolument recevoir un traitement antiviral pour faire baisser la charge virale et faire remonter son taux de T<sub>4</sub>
* en dessous de 200/mm{{3}} le patient est immunodéprimé et risque très fortement de souffrir de multiples [[Maladie opportuniste|maladies opportunistes]] liées au Sida. Là également, le malade doit être placé sous traitement
La différence entre deux mesures de charge virale espacées dans le temps permet d'évaluer la vitesse de réplication du VIH et par voie de conséquence la progression de l'infection. Il y a un lien direct entre la charge virale et le niveau du déficit immunitaire, occasionné principalment par la disparition des lymphocytes T<sub>4</sub>. La charge virale est définie en mesurant la concentration de l'ARN virale dans le sang. Cette mesure peut varier grandement selon les méthodes employées, et pour cette raison il est important que toutes les évaluations de charge virale soient effectuées dans le même laboratoire avec la même technique<ref name="retrovirus_page_21">{{fr}} [http://anne.decoster.free.fr/d1viro/vtelechar/vpoly/hiv05.pdf ''Les rétrovirus''], dans la section ''Évaluer la réplication virale'', page 21</ref>. C'est le [[Logarithme|log<sub>10</sub>]] du nombre de copies/mL qui est utilisé pour évaluer la variation dans le temps de la charge virale. Une variation supérieure ou égale à 0,5 est significative<ref name="retrovirus_page_21" />.
C'est le cumul de ces deux informations qui permettent au médecin de définir le traitement du patient.
==Physiopathologie==
[[Image:Hiv-timecourse-Fr 01.png|480px|thumb|right|L'évolution de l'infection par le VIH est dite persistante productive et est représentée par ce diagramme qui montre la relation entre la charge virale et le nombre de lymphocytes T<sub>4</sub>
{{legend-line|blue solid 2px|Nombre de lymphocytes T<sub>4</sub> par mm<sup>3</sup> de [[Plasma sanguin|plasma]]}}
{{legend-line|red solid 2px|Nombre de copies de l'ARN virale par mL de plasma}}]]
L'infection par le VIH évolue en plusieurs phases pouvant se succéder dans le temps :
* la primo-infection avec (50 à 75 % des cas) ou sans symptômes ; c'est la phase de séroconversion qui suit la contamination.
* une phase de latence, parfois accompagnée d'un état de lymphadénopathie généralisée,
* une phase à symptômes mineurs de l'infection à virus de l'immunodéficience humaine,
* la phase d'immunodépression profonde ou stade de Sida généralement symptomatique.
Dès la primo-infection, le virus se réplique activement dans l'organisme avec une production de dix milliards de virions quotidiennement, entraînant la destruction d'environs cinq milliards de [[Cellule CD4+|lymphocytes T CD4+]]<ref name="revuepraticien49">Delfraissy JF ''Mécanismes immunologiques et virologiques impliqués dans l'infection à virus de l'immunodéficience humaine : impact des traitements'' La Revue du Praticien 1999,49 ;1740-1745</ref>. Cette réplication se stabilise après quelques semaines à un niveau plus ou moins important selon les sujets. Le système immunitaire hyperactivé compense partiellement la destruction massive des lymphocytes T CD4+ en augmentant leur production, mais l'infection à VIH persiste malgré tout, avec pour conséquence l'émergence et la [[Sélection naturelle|sélection]] de virus [[Mutation (génétique)|mutants]] qui échappent à la réponse immune de l'hôte.
Des chercheurs du CNRS, de l'Institut Curie et de l'Institut Pasteur ont découvert que le virus modifiait le [[Potentiel hydrogène|pH]] des compartiments cellulaires où il s'accumule dans les macrophages, empêchant ainsi l'activation des enzymes chargées de le dégrader<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://www.pasteur.fr/actu/presse/com/communiques/07VIH_cnrs_inserm.htm
|titre=Découverte de la stratégie du VIH pour se multiplier dans certains globules blancs
|id=Découverte de la stratégie du VIH pour se multiplier dans certains globules blancs
|auteur=Institut Pasteur
|éditeur=[[Institut Pasteur]]
|en ligne le={{date|21|août|2007}}
|consulté le={{date|27|août|2007}}
}}
[http://www.pasteur.fr/actu/presse/com/communiques/07VIH_cnrs_inserm.htm ''Découverte de la stratégie du VIH pour se multiplier dans certains globules blancs'']</ref>.
Pendant plusieurs années, les lymphocytes T CD4+ semblent se renouveler rapidement malgré leur destruction par le virus, jusqu’à ce que l'épuisement des organes lymphoïdes centraux ([[Thymus (anatomie)|thymus]]) ne permette plus leur régénération. La destruction des lymphocytes T CD4+ est bien souvent due à l'hyperactivation de ces cellules par interaction avec certaines structures du virus et non à une destruction directe par le VIH<ref name="revuepraticien49"/>. Après dix à quinze ans d'évolution spontanée sans traitement, le sujet est immunodéprimé (stade [[Syndrome d'immunodéficience acquise|Sida]]), des [[Maladie infectieuse|pathologies infectieuses]] ou [[Tumeur|tumorales]] rares (dites [[Maladie opportuniste|opportunistes]]) surviennent et conduisent au décès. Actuellement les traitements [[Antirétroviral|antirétroviraux]] évitent ou retardent l'évolution vers le stade Sida en maintenant les niveaux de réplication du virus au plus bas possible<ref name="revuepraticien49"/>.
La destruction du système immunitaire et la progression clinique avec apparition de maladies opportunistes sont directement liées au taux sanguin des lymphocytes T CD4+ du patient<ref>Ho DD, Neumann AU, Perelson AS, Chen W, Leonard JM, Markowitz M. Rapid turnover of plasma virions and CD4 lymphocytes in HIV-1 infection. Nature 1995 Jan 12;373(6510):123-6.
</ref>. L'efficacité des traitements antirétroviraux est évaluée par le niveau de réplication virale mesurée par la charge virale VIH (taux d'ARN plasmatique), la mesure de taux de lymphocytes T CD4+ (immunodepression) et par l'état clinique du patient.
=== Non-progresseur à long terme ===
Plusieurs cas de personnes séropositives ont réussi à garder pendant une longue durée (au minimum 8 ans) naturellement (c'est-à-dire sans traitement) un taux de CD4 normal (supérieur à 500/mm³) et une charge virale basse, voire indétectable pour certains<ref>{{fr}} [http://anne.decoster.free.fr/d1viro/vtelechar/vpoly/hiv05.pdf ''Les rétrovirus''], page 15 et suivantes, dans la section ''Les non-progresseurs à long terme''</ref>{{,}}<ref>{{fr}} [http://www.pistes.fr/Transcriptases/35_132.htm ''Les asymptomatiques à long terme : virus peu agressif ou immunité démultipliée ?'']</ref>. Mais toutes ont fini par atteindre le stade Sida. Le plus long est resté 18 ans dans un état asymptomatique. Ces personnes sont dites non-progresseurs à long terme ou encore asymptomatiques à long terme (ALT).
Il n'existe pas de modèle unique, certains patients restent dans un état asymptomatique sans évolution significative de leur état, d'autres connaissent une lente détérioration de leur système immunitaire.
==Épidémiologie==
[[Image:HIV Epidem.png|thumb|250px|right|[[Prévalence]] des porteurs du VIH dans le monde (2006)]]Dans le monde, chaque année, il y a environ 2,5 millions de nouvelles infections. En 2007 il y avait 33,2 millions de personnes vivant avec le virus de l'immunodéficience humaine, la majorité étant en Afrique sub-Saharienne et 2,1 millions de morts du [[Syndrome d'immunodéficience acquise|sida]]<ref>{{en}} [http://data.unaids.org/pub/EPISlides/2007/071120_epiupdate_fr.pdf ''Chiffres de novembre 2007, Onusida'']</ref>.
En [[France]], pour l'année [[2005]], l’[[Institut de Veille Sanitaire]] estime à environ {{formatnum:6700}} les nouveaux cas de séropositivité (chiffre stable depuis 2003). Les rapports hétérosexuels représentent la moitié de ces nouveaux cas et concernent pour moitié des personnes d’Afrique subsaharienne. Entre 2003 et 2005, le nombre de découvertes de séropositivité a diminué chez les femmes mais augmenté chez les homosexuels qui représentent 27 % des nouveaux cas de séropositivité. La proportion d’infections à VIH-2 est de 1,4 % en 2005. Parmi les infections à VIH-1, la proportion de sous-types non-B a diminué entre 2003 et 2005 (de 50 % à 41 %). En 2005, 5,3 millions de sérologies VIH ont été réalisées, soit une augmentation de 8 % par rapport à 2004, tandis que le nombre de sérologies confirmées positives s’est stabilisé<ref>{{fr}} [http://www.invs.sante.fr/beh/2006/48/beh_48_2006.pdf Surveillance de l’infection à VIH-sida en France], 2005, www.invs.sante.fr.</ref>.
==Traitements==
Les [[Antirétroviral|antirétroviraux]] constituent l'arsenal thérapeutique contre le VIH, qui s'étoffe progressivement. Une vingtaine de médicaments antirétroviraux sont disponibles en [[2006]] et ont pour but d'interférer sur différents mécanismes, d'une part sur les enzymes du VIH nécessaires à sa réplication et d'autre part sur ses mécanismes d'entrée dans la cellule.
Grâce à la [[trithérapie]] utilisée depuis [[1996]], la [[mortalité]] due au [[Syndrome d'immunodéficience acquise|Sida]] a chuté de façon significative partout où ces nouveaux traitements étaient disponibles<ref>{{en}}[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=retrieve&db=PubMed&list_uids=16514305&dopt=medline Effective therapy has altered the spectrum of cause-specific mortality following HIV seroconversion]. AIDS. 2006 Mar 21;20(5):741-9. [http://www.aidsonline.com/pt/re/aids/fulltext.00002030-200603210-00014.htm;jsessionid=GTtfjG9WJ3VkgYmwQ6LY41H3vDvYLvQtyhQ9nnFL2zbkRn5bmGTl!-2117787203!-949856144!8091!-1 Full text].</ref>{{,}}<ref>[http://survivreausida.net/a6885-jean-francois-delfraissy-dix-ans-de-trith.html « Dix ans de trithérapie ont changé la face de la maladie »], Pr Jean-François Delfraissy, directeur de l’Agence nationale de recherches sur le sida, Libération, 2 mars 2006.</ref>{{,}}<ref>Voir {{en}}[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&list_uids=9516219 Declining morbidity and mortality among patients with advanced human immunodeficiency virus infection. HIV Outpatient Study Investigators.], N Engl J Med. 1998 Mar 26;338(13):853-60. et {{fr}} [http://www.pistes.fr/transcriptases/65_921.htm Baisse de la morbidité et de la mortalité chez les patients à un stade avancé de l'infection VIH], transcriptases, n°65 - mai 98.</ref>{{,}}<ref>{{fr}} [http://www.pistes.fr/transcriptases/119_427.htm Séropositivité, HAART et mortalité], transcriptases, n°119 - décembre/janvier 2005.</ref>. C'est ainsi qu'aux États-Unis, l'utilisation à grande échelle de trithérapies a fait passer le nombre de décès chaque année de {{formatnum:49000}} en [[1995]] à environ {{formatnum:9000}} en [[2001]]<ref>[[Référence:Biologie (Raven, Johnson, Losos, Singer)|''Biologie'']], chapitre 26.3, page 538</ref>.
Ces médicaments peuvent avoir des effets secondaires passagers ou permanents qui peuvent conduire à l'arrêt ou surtout la modification du traitement, sachant que correctement suivis ils ont une efficacité relativement importante.
===Antirétroviraux===
{{voir|Antirétroviral}}
La recherche sur le VIH/Sida étant très importante, de nombreuses recherches, études et publications voient régulièrement le jour. Mais la durée entre la conception d'une molécule et son [[autorisation de mise sur le marché]] oscillant entre sept et douze ans en France<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://www.leem.org/htm/themes/article.asp?id_sous_rubrique=95&id_article=386
|titre=Innovation : comment les médicaments sont-ils découverts ?
|id=Innovation : comment les médicaments sont-ils découverts ?
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|lien auteur=
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|éditeur=Les entreprises du médicament
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|en ligne le={{date|31|mai|2006}}
|consulté le={{date|14|octobre|2007}}
}}</ref>, il faut relativiser les effets d'annonces qui pour certaines ne déboucheront pas sur une application directement pratique dans la lutte contre le VIH/Sida.
Ainsi les seuls médicaments reconnus comme réellement efficaces sont les antirétroviraux ayant reçu leur autorisation de mise sur le marché.
Les antirétroviraux sont classés suivant leur domaine d'action :
====Inhibiteurs de la transcriptase inverse====
{{voir|Inhibiteurs de la transcriptase inverse}}
Les inhibiteurs de la transcriptase inverse empêchent la synthèse d'ADN proviral (c'est-à-dire qui va permettre la duplication du virus) à partir de l'ARN viral. On trouve dans cette classe :
;Inhibiteurs nucléosidiques (INTI)
Les [[Inhibiteurs nucléosidiques|INTI]] ont constitué la première classe d'antirétroviraux mise sur le marché en [[1985]]. Ils comprennent la [[zidovudine]] (AZT) (synthétisée en [[1964]]), la [[didanosine]] (ddI), la [[zalcitabine]] (ddC), la [[stavudine]] (d4T), la [[lamivudine]] (3TC) ([[1989]] et utilisée à partir de [[1995]]), l'[[abacavir]] (ABC) et l'[[emtricitabine]] (FTC).
Les mutations du génome à cause de la transcriptase inverse confèrent au VIH une résistance aux INTI qui peut être croisée entre plusieurs INTI. Ces composés sont tous neutres ou réducteurs, à l'exception de l'AZT qui est un oxydant.
;Inhibiteurs non nucléosidiques (INNTI)
Les [[Inhibiteurs non nucléosidiques|INNTI]] sont des inhibiteurs puissants et très sélectifs de la transcriptase inverse du VIH. On trouve dans cette classe la [[nevirapine]] et l'[[efavirenz]]. Ils ne sont actifs que sur les VIH-1. Il sont métabolisés en [[phénol (molécule)|phénol]]s par oxydation.
;Analogues nucléotidiques
Les [[analogues nucléotidiques]] comme le [[ténofovir]] qui a été mis sur le marché en [[2002]], sont des composés organophosphorés.
====Inhibiteurs de la protéase====
{{voir|Inhibiteurs de la protéase}}
La classe des inhibiteur de la protéases (IP) est une classe d'antirétroviraux mise sur le marché en [[1996]]. Elle a constitué un tournant majeur dans les stratégies thérapeutiques contre le virus de l'immunodéficience humaine. Ils agissent en inhibant l'action de la protéase virale qui permet le découpage et l'assemblage des protéines virales, processus indispensable à l'obtention de virus infectieux. On obtient alors des [[virion]]s incapables d'infecter de nouvelles cellules. Les IP sont actifs sur le VIH-1 et le VIH-2, et ne créent pas de résistance croisée avec les INTI ou les INNTI.
====Inhibiteurs d'intégrase====
{{voir|Inhibiteurs d'intégrase}}
Ces inhibiteurs bloquent l'action de l'intégrase et empêchent ainsi le génome viral de se lier à celui de la cellule cible.
Deux inhibiteurs existent : le [[raltegravir]] (MK0518) et l'[[elvitegravir]] (GS9137).
====Inhibiteurs de fusion et d'entrée====
{{voir|Inhibiteurs d'entrée|inhibiteurs de fusion}}
Les inhibiteurs de fusion-lyse interviennent au moment de la pénétration et bloquent la protéine gp41 l'empêchant de se lier à la membrane cytoplasmique.
Plusieurs produits sont à l'étude et seul l'[[enfuvirtide]] a reçu une autorisation de mise sur le marché américain en [[2003]]. Son mode d'administration est l'[[injection (médecine)|injection]] par voie sous-cutanée.
===Choix thérapeutique===
Depuis le début des [[années 1990]] des [[trithérapie]]s ont vu le jour pouvant être prescrites en fonction du stade clinique, du taux de [[lymphocyte]]s T CD4+ et de la [[charge virale]]. Ce traitement antirétroviral comprend actuellement trois médicaments, en général deux inhibiteurs nucléosidiques de la transcriptase inverse, associés à un inhibiteur des protéases ou à un inhibiteur non nucléosidique de la transcriptase inverse, ou parfois à un troisième inhibiteur nucléosidique de la transcriptase inverse ("trithérapies"). Un inhibiteur de fusion y est éventuellement associé.
Il n'y a pas de critère précis pour tous les patients fixant le début d'un traitement antirétroviral, cette décision doit être adaptée à chaque patient. Il existe tout de même quelques critères basés sur le nombre de lymphocytes T CD4+. Ainsi, lorsqu'un séropositif a un taux de CD4+ supérieur à 350/mm<sup>3</sup>, il n'est pas nécessaire de commencer un traitement. Mais sous la barre des 200/mm<sup>3</sup>, il est impératif de commencer un traitement. Le nombre de CD4 par rapport au nombre totaux de lymphocytes est également un critère. Ainsi lorsque les CD4+ représentent moins de 15% de tous les lymphocytes, un risque d'infection par des maladies opportunistes apparaît<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://www.sante.gouv.fr/htm/actu/delfraissy_2004/rapport.pdf
|titre=Prise en charge thérapeutique des personnes infectées par le VIH - Rapport 2004 - Sous la direction du Professeur Jean-François Delfraissy
|id=Prise en charge thérapeutique des personnes infectées par le VIH - Rapport 2004 - Sous la direction du Professeur Jean-François Delfraissy
|auteur=Jean-François Delfraissy et autres
|année=2004
|éditeur=Éditions Flammarion
|page=43
|consulté le={{date|3|décembre|2007}}
}}</ref>.
Lors d'un premier traitement, la quasi-totalité des patients voient leur charge virale plasmatique rendue indétectable dans les six premiers mois. Ce premier traitement doit être le plus simple et le mieux toléré possible. C'est la non [[Observance (pharmacothérapie)|observance]] du traitement qui est la principale cause de l'échec thérapeutique<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://www.sante.gouv.fr/htm/actu/delfraissy_2004/rapport.pdf
|titre=Prise en charge thérapeutique des personnes infectées par le VIH - Rapport 2004 - Sous la direction du Professeur Jean-François Delfraissy
|id=Prise en charge thérapeutique des personnes infectées par le VIH - Rapport 2004 - Sous la direction du Professeur Jean-François Delfraissy
|auteur=Jean-François Delfraissy et autres
|année=2004
|éditeur=Éditions Flammarion
|page=48-49
|consulté le={{date|3|décembre|2007}}
}}</ref>.
Bien que les traitements antirétroviraux soient très efficaces lorsqu'ils sont bien suivis, le VIH est toujours présent dans l'organisme, seule sa multiplication est ralentie et bien qu'indétectable dans le sang, ce dernier, ainsi que le sperme, restent contagieux<ref>{{fr}} {{Lien web
|url=http://www.santeguerir.fr/contenu.php?id_guerir=7314
|titre=Sida et trithérapie
|id=Sida et trithérapie
|auteur=Gérard Ammerich
|année=2004
|éditeur=SantéGuérir
|consulté le={{date|3|décembre|2007}}
}}</ref>.
==Prévention==
Il n'existe malheureusement pas de vaccin efficace. Seul le préservatif offre une protection efficace lors des rapports sexuels. Les dons de sang font l'objet d'une sélection des donneurs, de dépistages systématiques et de traitements spécifiques. Aussi, la prévention se fait par l'utilisation de seringues à usage unique en toute occasion, en particulier en cas de toxicomanie intraveineuse ou traitement substitutif.
==Hypothèses alternatives==
{{article détaillé|Hypothèses alternatives sur la responsabilité du VIH dans le SIDA}}
Une petite minorité de scientifiques et d'activistes remettent en question le lien entre le VIH et le Sida<ref name=Duesberg>{{
cite journal
| author=Duesberg, P. H.
| url=http://www.duesberg.com/papers/ch2.html
| title=HIV is not the cause of AIDS
| journal=Science | year=1988 | pages=514, 517 | volume=241 | issue=4865
| id= PMID 3399880
}}</ref>, voire l'existence même du VIH<ref name=Papadopulos>{{
cite journal
| author=Papadopulos-Eleopulos, E., Turner, V. F., Papadimitriou, J., Page, B., Causer, D., Alfonso, H., Mhlongo, S., Miller, T., Maniotis, A. and Fiala, C.
| url=http://www.theperthgroup.com/SCIPAPERS/MHMONT.pdf
| title=A critique of the Montagnier evidence for the HIV/AIDS hypothesis
| journal=Med Hypotheses | year=2004 | pages=597-601 | volume=63 | issue=4
| id= PMID 15325002
}}</ref>{{,}}<ref>{{ouvrage
|éditeur=Marco Pietteur
|titre=Sida : Supercherie scientifique et arnaque humanitaire
|auteur=Jean-Claude Roussez
|langue=fr
|année=[[2004]]
|mois=mai
|pages=160
|format=Broché
|isbn=2874340162}}</ref>, ou encore la validité des tests VIH actuels<ref name=Papadopulos2>{{
cite journal
| author=Papadopulos-Eleopulos, E., Turner, V. F., Papadimitriou, J., Page, B., Causer, D.
| url=http://www.theperthgroup.com/SCIPAPERS/EMAHIVLetterandReply.pdf
| title=No proof HIV antibodies are caused by retroviral infection
| journal=Emerg Med Australas. | year=2006 | pages=308-9 | volume=18 | issue=3
| id= PMID 16712545
}}</ref>. Récemment, une personne accusée d'avoir eu des relations sexuelles non protégées a utilisé ces concepts comme système de défense<ref name=Parenzee>{{Lien web |url=http://www.news.com.au/adelaidenow/story/0,22606,21212272-5006301,00.html |titre=Hogwash claim in HIV appeal |auteur=Colin James |éditeur=[[the Advertiser]] |année=12 février 2007}}</ref>{{,}}<ref name=MacDonald>{{Lien web |url=http://www.theaustralian.news.com.au/story/0,20867,21306298-5006787,00.html |titre=AIDS specialist called to explain evidence |auteur=Jeremy Roberts |éditeur=[[The Australian]] |année=12 février 2007}}</ref>. Ces contestations ne sont pas reprises par la plupart des membres de la communauté scientifique qui accusent ces personnes d'ignorer l'évidence du rôle du VIH dans le Sida et d'être une menace pour la [[santé publique]] en dissuadant la population de se faire tester ou les malades d'être sous des traitements antirétroviraux qui ont fait leurs preuves<ref name=Cohen>{{
cite journal
| author=Cohen, J.
| title=The Duesberg phenomenon
| journal=Science | year=1994 | pages=1642-1644 | volume=266 | issue=5191
| id= PMID 7992043
| format= PDF
| url=http://www.sciencemag.org/feature/data/cohen/266-5191-1642a.pdf
}}</ref>{{,}}<ref name=Kaiser>{{pdf}} {{Lien web |url=http://www.kaisernetwork.org/health_cast/uploaded_files/081306_ias_sat_journalism.pdf |titre=HIV Science and Responsible Journalism. Seminar at the XVI International AIDS Conference |auteur=Various |éditeur=[[Kaiser Family Foundation]] |année=13 août 2006 |consulté le=7 décembre 2006}}</ref>.
Ces dissidents affirment que l'approche officielle du Sida, qui considère comme acquise sa causalité rétrovirale, a eu pour conséquence des diagnostics erronés, l'apparition d'une terreur psychologique et d'une certaine forme de racisme, l'utilisation de traitements toxiques et le gaspillage de fonds publics<ref name=controversy>{{Lien web |url=http://rethinkingaids.com/ |titre=Controversy |auteur=Various |éditeur=[[rethinkingaids.com]]}}</ref>. Ces opinions sont largement rejetées<ref name=Cohenseries>{{
cite journal
| author=Cohen, J.
| title=The Controversy over HIV and AIDS
| journal=Science | year=1994 | pages=1642-1649 | volume=266 | issue=5191
| url=http://www.sciencemag.org/feature/data/cohen/266-5191-1642a.pdf
}}</ref>{{,}}<ref name=NIAIDlink>{{Lien web |url=http://www3.niaid.nih.gov/news/focuson/hiv/resources/ |titre=Focus on the HIV-AIDS Connection: Resource links |auteur=Various |éditeur=[[National Institute of Allergy and Infectious Diseases]] |consulté le=7 septembre 2006}}</ref> et sont considérées comme de la [[pseudo-science]] par la plupart des membres de la communauté scientifique.
== Voir aussi ==
* [[Gp120]];
* [[Discrimination des porteurs du VIH]];
* [[Virus de l'immunodéficience féline]], ou VIF, qui provoque le sida du [[chat]];
* Le programme [[FightAIDS@Home]].
===Sources===
* {{fr}} [http://www.pasteur.fr/actu/presse/dossiers/Sida/decouverte.htm ''La découverte du virus du Sida en 1983''], sur le site de l'Institut Pasteur (pour la section ''Histoire'')
* {{fr}} [http://anne.decoster.free.fr/d1viro/vtelechar/vpoly/hiv05.pdf ''Les rétrovirus''], cours de Anne Decoster (pour la section ''Histoire'', ''Structure'', ''Transmission'', ''Cycle de réplication'', ''Variabilité génétique'' et ''Diagnostic et suivi infectieux'')
* {{fr}} [http://www.eao.chups.jussieu.fr/polys/viro/poly/viro.pdf ''Virologie''], cours de Jean-Marie Huraux, Henri Agut, Anne-Marie Fillet, Vincent Calvez, Vincent Thibault, Agnès Gautheret-Dejean, Anne-Geneviève Marcelin, Claire Deback (pour la section ''Structure'', ''Transmission'', ''Cycle de réplication'', ''Variabilité génétique'' et ''Diagnostic et suivi infectieux'')
* Chapitre 26 de [[Référence:Biologie (Raven, Johnson, Losos, Singer)|''Biologie'']] (pour la section ''Cycle de réplication'')
=== Références ===
{{Références|colonnes = 2}}
=== Liens externes ===
{{commons|Category:HIV|le VIH}}
* {{en}} [http://www.hivmedicine.com/ ''HIV Medecine''], livre médical synthétisant les connaissances sur les traitements du VIH/Sida en [[2006]]
* {{en}} [http://www.sparks-of-light.org/The%20Key%20HIV=AIDS%20Science%20Papers%20without%20comments.pdf Les publications de Gallo et Popovic dans "Science" en 1984]
* {{en}} [http://www.sparks-of-light.org/cited%20documents%20-scfic/draft_of_m_popovic_05.04.84_science_article_undated.pdf Le premier "jet" de la publication précédente]
* {{en}} [http://www.worldaidsday.org World AIDS Day 2005 - Décembre 1]
* {{en}} [http://www.niaid.nih.gov/newsroom/focuson/hiv00/default.htm National Institute of Health: The Evidence that HIV causes AIDS]
* {{en}} [http://www.healtoronto.com/nih/ NIH Evidence Rebuttal]
* {{en}} [http://www.virusmyth.net/aids/data/cfmullis.htm Interview with Kary Mullis about HIV and AIDS (1994)]
* {{fr}}{{en}} [http://www.cmeonhiv.com Formation Médicale Continue sur le VIH]
* {{en}} [http://hivinsite.ucsf.edu HIV InSite] L'Université de Californie à San Francisco
* {{fr}} [http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/SIDA/images/cycle.swf Mode de fonctionnement du virus]
* {{fr}} [http://georges.dolisi.free.fr/Physiopathologie/sida_description.htm Intégration et mode expression du virus par Georges Dolisi]
* {{fr}} [http://www.greenfacts.org/fr/sida/index.htm Sida et VIH, porteurs du virus dans le monde & défis à relever] - résumé par GreenFacts d'un rapport de ONUSIDA (2006)
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{{lien BA|en}}
[[Catégorie:VIH/Sida|*]]
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[[nl:Hiv]]
[[no:Humant immunsviktvirus]]
[[oc:Virus de l'immunodeficiéncia umana]]
[[pl:Wirus zespołu nabytego braku odporności]]
[[ps:اېچ آی وي(HIV)]]
[[pt:Vírus da imunodeficiência humana]]
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[[sh:HIV]]
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[[sl:HIV]]
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[[sr:ХИВ]]
[[su:HIV]]
[[sv:HIV]]
[[th:เอชไอวี]]
[[tr:HIV]]
[[uk:ВІЛ (вірус)]]
[[yo:HIV]]
[[zh:人類免疫缺陷病毒]]
[[zh-min-nan:HIV]]